ИСТИНА

6S РНК E. coli является малой некодирующей РНК (нкРНК), способной связывать РНК-полимеразу и, тем самым, регулировать транскрипцию [1]. Известно, что в условиях дефицита питательных веществ клетки дикого типа E. coli имеют преимущество перед клетками с делецией гена 6S РНК (ΔS) [2], а в условиях щелочного стресса наблюдается обратная зависимость [3]. Согласно данным, ранее полученным в нашей научной группе, жизнеспособность мутантного штамма ΔS заметно снижается в присутствии высоких концентраций перекиси водорода. Таким образом, изучение 6S РНК-зависимой регуляции экспрессии генов в стрессовых условиях является актуальной задачей, решение которой позволит глубже понять физиологическую роль этой нкРНК. Целью исследования являлось установление влияния 6S РНК E. coli на экспрессию ряда белков окислительного стресса. Для этого методом количественной ПЦР (кПЦР) с обратной транскрипцией было оценено содержание мРНК 17 выбранных нами генов в штамме ΔS и в клетках дикого типа. Были подобраны условия выделения и очистки общей РНК, проведения обратной транскрипции и кПЦР, подобраны референсные гены – gyrA и gapA. Для последующего доказательства влияния 6S РНК на эффективность транскрипции гена ahpC, кодирующего алкилгидропероксидредуктазу, была сконструирована плазмида, содержащая репортёрный ген (бета-галактозидазу) под контролем промотора ahpC. Работа выполнена при поддержке гранта РНФ (№ 14-24-00061).