ИСТИНА

При подборе компонентов пробиотических препаратов для лечения воспалительных заболеваний кишечника важно оценивать не только численность и качественный видовой состав микрофлоры, но и механизмы взаимного бактериального влияния, которые способствуют формированию нормобиоза ЖКТ. Наиболее представленный среди фекальной микробиоты род Bacteroides использует систему бактериальной секреции VI типа для проведения меж- и внутривидовой конкурентной борьбы. Показано, что используемые представителями рода пары сопряженных белков оказывают ингибирующее действие на его патогенных представителей [1, 2]. Таким образом, основной задачей данного исследования являлась идентификация пар эффектор-иммунопротектор у представителя рода Bacteroides - Bacteroides fragilis, а также определение способа доставки белков до клетокмишеней. Используя данные сравнительного полногеномного секвенирования клинических изолятов Bacteroides fragilis, были выявлены участки генома, кодирующие белки-эффекторы и иммунопротекторы. Для определения способа доставки указанных белков методом ультрацентрифугирования были выделены препараты везикул, культуральной среды и отдельных фракций бактериальных клеток токсигенного штамма. Все полученные препараты были визуализированы при помощи ПЭМ и подготовлены для протеомного анализа методом ВЭЖХ-МС/МС. На основе данных протеогеномного профилирования были составлены базы триптических пептидов для идентификации целевых белков. Согласно полученным данным, в составе препарата везикул были выявлены белки иммунной защиты, дающие преимущество виду в конкурентной борьбе. Учитывая значительный потенциал данного способа секреции, была высказана гипотеза о распределении белков иммунной защиты посредством везикул внутри популяции для своевременного ингибирования белков-эффекторов. Таким образом, активация “кворум-сенсинга” в условиях конкурентной борьбы позволяет наиболее эффективно отвечать на воздействие со стороны конкурирующего вида. Использование содержащих иммунопротекторы везикул как дополнительных компонентов пробиотиков может существенно улучшить эффективность препаратов при комплексном лечении ВЗК.