![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Метод ВЭЖХ-МС широко используется для определения и идентификации биологически активных соединений в экстрактах и продуктах растений из-за его высокой информативности. Обработка и интерпретация данных ЖХ-МС - сложная задача, и в представленной работе использовались алгоритмы многомерного статистического анализа для извлечения полезной химической информации и идентификации кластеров похожих образцов. 19 растений, принадлежащих к семейству Apiaceae, проанализированы методами ВЭЖХ-МС высокого и низкого разрешения. Были предложены протоколы предварительной обработки необработанных данных. Были рассмотрены два типа дальнейшего анализа данных: разложение тензора с помощью PARAFAC и разложение после развёртывания тензора в двух измерениях. Для развернутых тензоров были рассмотрены четыре подхода к сокращению и факторизации данных: PCA, ICA, NMF и неконтролируемый выбор признаков. Найдено оптимальное количество компонентов для каждого из этих методов. Результаты, полученные этими пятью методами, сравнивались по нескольким критериям: анализ AUROC, коэффициент силуэта, время вычисления и количество шумовых компонент. PCA и UFS оказались наиболее подходящими методами для работы с рассматриваемыми типами данных. Было идентифицировано 23 потенциальных хемотаксономических маркера, большинство из которых относятся к классу кумаринов. Показано распределение этих биомаркеров у разных видов семейства Apiaceae.
№ | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
---|