ИСТИНА

До недавнего времени дизайн препаратов для подавления активности ферментов был основан на поиске конкурентных ингибиторов, предотвращающих связывание фермента с субстратами и кофакторами. В то же время наряду с активными центрами ферменты содержат множественные участки связывания, роль которых неизвестна. Мы предлагаем использовать комплексный подход на основе биоинформатического анализа суперсемейств ферментов и молекулярного моделирования для идентификации новых регуляторных центров и выявления особенностей структурной организации активных центров, чтобы проводить поиск лигандов, способных оказывать селективное влияние на функциональные свойства выбранных мишеней. Разработана платформа веб-серверов (см. https://biokinet.belozersky.msu.ru/mustguseal, серверы Mustguseal, Zebra2 и 3D, pocketZebra, vsFilt, visualCMAT, представляющая возможность применения биоинформатических методов для изучения структурного и функционального разнообразия ферментов, поиска и классификации центров связывания лигандов. Разрабатываемый подход представляет общую методологию поиска модуляторов белков и ферментов – прототипов новых лекарственных препаратов. С его использованием обнаружены селективные ингибиторы ферментов Mycobacterium tuberculosis (транскетолазы, L,D-транспептидазы, глицеральдегид 3-фосфатдегидрогеназы), способные подавлять рост патогена, селективные ингибиторы ферментов семейств поли(ADP-рибозо)-полимераз и металлопротеаз.