ИСТИНА

Развитие многих нейродегенеративных заболеваний связано с образованием в организме патологических белковых агрегатов. Механизмы заболеваний этой группы обладают рядом гомологий, что позволяет предлагать подходы, общие для всех таких механизмов. Один из таких механизмов – прионный: белки, принявшие патологическую конформацию, могут индуцировать агрегацию [1]. При помощи статистической термодинамики [2,3] построена математическая модель, позволяющая получать равновесные распределения белковых агрегатов по размерам. В модели используется небольшое число параметров: константа связывания белка с матрицей (описывающая инициацию роста агрегата), а также константы ассоциации, каждая из которых соответствует образованию одного из типов связей между белками в агрегате. Графики распределений, генерируемые моделью, сопоставляются с экспериментальными распределениями [4] амилоидных фибрилл по длине в растворе, что позволяет получать оценки констант ассоциации. Модель может быть применена для исследования патологической агрегации белков разной природы. Понимание молекулярного механизма образования таких агрегатов позволит подобрать эффективные инструменты подавления патологии, блокирующие развитие агрегации белков. Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (грант № 19-74-30007). 1. Kozin, S.A. Role of Interaction between Zinc and Amyloid Beta in Pathogenesis of Alzheimer’s Disease // Biochemistry Moscow, 2023, vol. 88 (Suppl 1), pp, S75-S87, doi: 10.1134/S0006297923140055. 2. Нечипуренко Ю.Д. Анализ связывания биологически активных соединений с нуклеиновыми кислотами. Москва; Ижевск: Ин-т комп. исслед., 2015, 187 с., ISBN 978-5-4344-0295-8. 3. Spouge J. Equilibrium polymer size distributions // Macromolecules, 1983, vol. 16, no. 1, pp. 121-127, doi: 10.1021/ma00235a024. 4. Xue W.F., Homans S.W., Radford S.E. Amyloid fibril length distribution quantified by atomic force microscopy single-particle image analysis // Protein Engineering, Design & Selection, 2009, vol. 22, no. 8, pp. 489-496, doi: 10.1093/protein/gzp026.