ИСТИНА

Пластоцианин и цитохром c6 — белки-переносчики электронов в электронтранспортной цепи цианобактерий и хлоропластов, осуществляющие перенос электрона от цитохрома f цитохром-b6f-комплекса на фотосистему I.Мы полагаем, что взаимодействие белка – подвижного переносчика электронов с мультиферментным комплексом можно условно разделить на несколько этапов. Предполагается, что на первом этапе взаимодействия белок-переносчик диффундирует под действием случайных броуновских сил и электростатических взаимодействий с фотосистемой. Результатом диффузии является формирование столкновительного комплекса, который затем может перейти в финальный комплекс, в котором возможен туннельный перенос электрона. В данной работе мы исследуем процесс формирования столкновительного комплекса белков-переносчиков с фотосистемой I методом броуновской динамики в программе ProKSim.Для моделирования были выбраны белки Chlamydomonas reinhardtii. Для каждого белка-переносчика и каждого порогового значения энергии (4kT, 6kT, 8kT) произведено по 10000 запусков динамики. Полученные структуры электростатических столкновительных комплексов далее подвергались кластерному анализу. Анализировалась подвижность структур, частоты контактов и кинетика формирования комплекса. Центральные структуры кластеров в дальнейшем могут быть использованы для моделирования формирования финального комплекса методом молекулярной динамики.