ИСТИНА

Системы рестрикции-модификации защищают прокариот от инвазий посторонней ДНК путем распознавания ее и расщепления. В нескольких десятках случаев показано снижение числа сайтов рестрикции в геномах прокариот и их вирусов. В данной работе изучено влияние систем рестрикции-модификации на число сайтов рестрикции для тысяч полностью секвенированных геномов прокариот и вирусов. Для оценки недопредставленности числа сайтов использован метод, предложенный С.Карлиным и соавт. Оказалось что сайты рестрикции, для которых в геноме бактерии или археи закодирована система рестрикции-модификации с данной специфичностью, недопредставлены примерно в половине случаев. В то же время число недопредставленных потенциальных сайтов рестрикции в среднем в три раза больше, чем число систем рестрикции-модификации в геноме. Наши данные подтверждают предположение о том, что часть недопредставленных потенциальных сайтов рестрикции могут быть сайтами рестрикции утерянных систем рестрикции-модификации и часть не недопредставленных актуальных сайтов рестрикции являются сайтами вновь образовавшихся или изменивших свою специфичность систем рестрикции-модификации. Таким образом, изучение недопредставленных в геноме сайтов может быть использовано для характеризации жизненного цикла систем рестрикции-модификации, по крайней мере, на уровне статистики.