Описание:Курс рассчитан на студентов второго года магистратуры. Основное задача курса - знакомство студентов с основными сигнальными путями, приводящими к активации транскрипции генов в ответ на внешние стимулы и реализации генетической информации.
Знакомство с основными принципами построения сигнальных путей. Обработка больших массивов литературных данных (data mining). Создание и поддержание словарей терминов. Современные программы для построения сигнальных путей. Знакомство с программой PathwayStudio и базой данных ResNet. Объекты на сигнальных путях на примере PathwayStudio и ResNet.
Основные сигнальные пути клетки высших млекопитающих. Сигналинг через GPCR, G-белки, рецепторы с киназной активностью, роль JAK и MAPK в передаче внутриклеточного сигнала. Кальций, диацилглицерол, инозитол-3-фосфат и другие внутриклеточные мессенджеры и активаторы клеточных процессов, включая регуляцию транскрипции.
Транскрипционные факторы и их взаимодействие. Комплексы транскрипционных факторов. Пути активация транскрипционной машины.
Примеры работы межклеточных и внутриклеточных сигнальных каскадов в норме. Клеточный цикл. Апоптоз. Формировании иммунного ответа. Воспалительный ответ. Формирование памяти. Действие витаминов. Действие нейромедиаторов. Пищевое поведение и функционирование желудочно-кишечного тракта. Лактация. Сон.
Примеры нарушения работы межклеточных и внутриклеточных сигнальных каскадов при различных патологиях. Онкология. Сердечно-сосудистые, неврологические, дерматологические заболевания. Заболевания эндокринной системы и нарушения метаболизма. Инфекционные заболевания.
Использования схем сигнальных путей для трактовки результатов транскриптомных и ассоциативных исследований и для планирования эксперимента.