Аннотация:В работе описан новый подход к построению 3d дескрипторов молекулярных графов, учитывающих геометрию молекулярной поверхности и ее локальные физико-химические свойства для решения задач «структура-свойство» и «структура-активность. Разработан алгоритм построения, оценена асимптотическая сложность и необходимая память алгоритма, рассмотрены дальнейшие возможные улучшения. Проект реализован в системе MatlabR2008а и на С++. Проведены вычислительные эксперименты на выборках молекул гликозидов, пиримидинов и стекла.