|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Построение дескрипторов молекулярных поверхностей в задаче «Структура – биологическая активность»дипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Кумсков М.И.
- Автор: Чичуа Виктория
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2007
- Аннотация: В работе предложен, проанализирован и реализован новый метод построения 3D дескрипторов в задаче «структура-свойство» (QSAR-задача) для молекулярных графов, проверен на выборке молекул, имеющих амбровый запах. На основе данных о 3D конформациях молекул строится молекулярная поверхность, на ней определяются особые точки(ОТ), которые классифицируются и маркируются. На основе локальных физико-химических свойств молекул формируется алфавит дескрипторов. Проект реализован в системе Matlab 7.0. При этом использовались как основной пакет программ, так и дополнительный пакет (Toolbox) FuzzyLogic. Проект состоит из порядка 3 модулей-процедур. Проведены вычислительные эксперименты на выборке молекул амбровых одорантов, состоящей из 50 молекул. Из них 37 являются биологически активными, 13 - неактивными. Разными модификациями алгоритма нахождения особых точек и построения дескрипторов получена матрица «молекула-признак», сформированная на основе набора из 703 дескрипторов. В дальнейшем, на одной из них удалось выделить два крупных кластера из 28 и 10 элементов с хорошей прогностической оценкой на скользящем контроле 78,6% и 80% соответственно.
- Добавил в систему: Кумсков Михаил Иванович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Chichua_Viktoriya-Diplom-2007.pdf | 3,9 МБ | 17 ноября 2015 [kumskov] |