|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Использование эволюционных алгоритмов для построения деревьев решений при классификации биологически активных молекулдипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Кумсков М.И.
- Автор: Деветьяров Дмитрий
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2006
- Аннотация: В работе предложен, проанализирован и реализован новый метод решения задачи «структура-свойство» (QSAR-задачи) для молекулярных графов в применении к конкретной выборке молекул амбровых одорантов с целью определения их биологической активности/неактивности. По завершении этапов вычисления множества особых точек на молекулярных поверхностях, формирования алфавита дескрипторов и построения матрицы «молекула-дескриптор» был разработан и применен новый метод поиска функциональной зависимости биологической активности от значений дескрипторов в виде дерева решений. Проект реализован в системе Matlab 7.0. При этом использовались как основной пакет программ, так и дополнительный пакет (Toolbox) Statistics, предлагающий широкий выбор инструментов для статистического исследования. Проект состоит из порядка 15 модулей-процедур. Проведены вычислительные эксперименты на выборке молекул амбровых одорантов, состоящей из 50 молекул. Из них 37 являются биологически активными, 13 - неактивными. Обработано две матрицы «молекула-признак», сформированных на основе разных наборов дескрипторов численностью 703 и 231 соответственно. В результате, на одной из них удалось выделить два крупных кластера из 28 и 10 элементов с хорошей прогностической оценкой на скользящем контроле 78,6% и 80% соответственно. Кроме того, была реализована обратная связь между этапом формирования дескрипторов и этапом поиска функциональной зависимости. После нахождения информативных 3D - дескрипторов предыдущего уровня реализована возможность построения на их основе 3D- дескрипторов следующего уровня.
- Добавил в систему: Кумсков Михаил Иванович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Devetyarov_Dmitrij-Diplom-2006.pdf | 372,1 КБ | 17 ноября 2015 [kumskov] | |
| 2. | Полный текст | Ispolzovanie_evolyutsionnyih_algoritmov_dlya_postroeniya_de… | 357,5 КБ | 21 августа 2018 [kumskov] |