|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Исследование возможности конструирования бифункциональных ингибиторов нейраминидазы вируса гриппадипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
- Автор: Евтеев С.А.
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2019
- Аннотация: Преодоление резистентности вируса гриппа является одной из актуальных задач медицины. Используемые в современной клинической практике препараты всё чаще оказываются неэффективными в отношении новых штаммов вируса. Причиной развития лекарственной устойчивости является возникновение мутаций в активном центре нейраминидазы – валидированной мишени современных противогриппозных препаратов. Этот ключевой фермент жизненного цикла вируса обеспечивает высвобождение вновь образованных вирионов из заражённой клетки. Одним из возможных способов преодоления резистентности является поиск бифункциональных ингибиторов, способных связываться одновременно с двумя участками на поверхности белковой мишени (например, перспективным участком является недавно обнаруженная полость-430). Важную роль в структуре подобных ингибиторов должен играть линкер, связывающий функциональные фрагменты. Исходя из анализа литературных данных, можно заключить, что работа, связанная с поиском линкера, подходящего для дизайна бифункционального ингибитора, активно ведётся различными научными группами, однако исследования в этой области ещё далеки от завершения. Целью данной работы стало изучение принципиальной возможности создания бифункциональных ингибиторов нейраминидазы и поиск оптимальной структуры линкера методами биоинформатики и молекулярного моделирования. Были поставлены следующие задачи: 1. Провести биоинформатический анализ перспективного участка связывания, полости-430. 2. Осуществить моделирование связывания известных ингибиторов нейраминидазы и охарактеризовать их взаимодействие с участком сиаловой кислоты (концевой остаток субстрата) и полостью-430. 3. Выявить наиболее характерные взаимодействия на границе данных участков связывания, которые следует учитывать при выборе подходящего линкера в структуре бифункциональных соединений. 4. Определить достоинства и недостатки различных типов линкеров, предложить оптимальный способ соединения функциональных фрагментов. 5. Осуществить компьютерный скрининг прототипов бифункциональных ингибиторов нейраминидазы; охарактеризовать конформацию линкера и взаимодействия с участком сиаловой кислоты и полостью-430.
- Добавил в систему: Нилов Дмитрий Константинович