|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Молекулярное моделирование доставки нуклеофила в активный центр пенициллинацилазы и реакционной способности комплекса ацилфермента с 6-аминопенициллановой кислотойдипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Кирилин Е.М., Швядас В.К.
- Автор: Архипова Татьяна Игоревна
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
- Год защиты: 2021
- Аннотация: С помощью метода метадинамики исследован путь доставки нуклеофила в активный центр нативной пенициллинациллазы и ее мутантных форм 𝛼S149K и 𝛽T384N. Показано, что введенные мутации изменяют траекторию доставки нуклеофила в активный центр фермента и увеличивают эффективность образования комплекса ацилфермент-нуклеофил, установлена роль остатка 𝛼R145 в ориентации 6-АПК в активном центре. Изучена реакционная способность двух комплексов ацилфермент-нуклеофил для фермента дикого типа и мутантной формы (в зависимости от расположения нуклеофила относительно 𝛼R145) с помощью QM/MM-метадинамики, определены профили реакции и оценены энергии переходов, установленно, что введенные мутации увеличивают эффективность синтеза (переноса ацильной группы на нуклеофил) по отношению к гидролизу ацильного донора.
- Добавил в систему: Швядас Витаутас-Юозапас Каятоно