РОЛЬ ЖИДКО-ЖИДКОСТНОГО РАЗДЕЛЕНИЯ ФАЗ В АРХИТЕКТУРЕ ИНТЕРФАЗНОГО ЯДРА - дипломная работа | ИСТИНА – Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных

Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
Автор: Магнитов Михаил Дмитриевич
Тип: Магистр
Организация, в которой проходила защита: Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)
Год защиты: 2021
Аннотация: Современные представления об организации хроматина в ядре эукариотических клеток основываются на результатах анализа данных высокопроизводительной фиксации конформации хромосом (Hi-C). Известно, что на близких расстояниях хромосомы эукариот разделены на топологически ассоциированные домены (ТАДы) [1], состоящие из петлевых взаимодействий хроматина [2], в то время как на дальних расстояниях активный и репрессированный хроматин пространственно разделены на А и B компартменты соответственно [3]. На основе полученных данных принята модель, согласно которой основные принципы пространственной организации генома реализуются посредством суперпозиции процессов активной экструзии петель (формирующей ТАДы и петли) и пассивной пространственной сегрегации хроматиновых доменов (формирующей A/B-компартменты) [4,5]. В то время как механизм экструзии петель был должным образом охарактеризован [6], процессы, обеспечивающие пространственную сегрегацию активного и неактивного хроматина, до сих пор остаются плохо изученными. Недавние исследования выявили, что процесс жидко-жидкостного разделения фаз играет важную роль в функциональной компартментализации ядра эукариотических клеток. Белки, способные участвовать в образовании фазово разделенных жидких конденсатов, часто обладают внутренне неупорядоченными регионами [7]. Эти регионы могут опосредовать слабые неспецифичные мультивалентные взаимодействия, которые при некоторых условиях запускают процесс жидко-жидкостного разделения фаз [8]. Внутренне неупорядоченные регионы есть во многих белках, присутствующих в репрессивных доменах хроматина [9,10], а также в компонентах механизма транскрипции [11–13], что позволяет им образовывать жидкие конденсаты как in vitro, так и in vivo. Как следствие, образование разных типов жидких конденсатов в ядре может лежать в основе сегрегации A/B-компартментов хроматина [14]. Однако, несмотря на достаточное число предложенных моделей и проведенных исследований, непосредственное значение процесса жидко-жидкостного разделения фаз для хроматина живых клеток до сих пор не установлено. В данном исследовании была поставлена цель изучить роль жидко-жидкостного разделения фаз в пространственной организации интерфазного хроматина человека. Чтобы получить представление о возможной роли этого процесса в трехмерной организации хроматина, в Институте 5 Биологии Гена РАН были получены клетки человека, обработанные 1,6-гександиолом, который разрушает жидкофазные конденсаты в клетках [15], и его последующей отмывкой, для получения клеток с восстановленным жидко-жидкостным разделением фаз. На полученных клетках был поставлен эксперимент по высокопроизводительной фиксации конформации хромосом Hi-C, позволяющий исследовать трехмерную структуру генома. На основании полученных экспериментальных данных для достижения поставленной цели были сформулированы следующие задачи: 1. Получить контактные Hi-C карты для контрольных, обработанных 1,6-гександиолом и восстановленных клеток. 2. Изучить влияние 1,6-гександиол-опосредованного нарушения жидко-жидкостного разделения фаз на хроматиновые A/B-компартменты. 3. Изучить влияние 1,6-гександиол-опосредованного нарушения жидко-жидкостного разделения фаз на топологически ассоциированные домены и петлевые взаимодействия.
Добавил в систему: Ульянов Сергей Владимирович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ЦЭМИ РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ЦЭМИ РАН

РОЛЬ ЖИДКО-ЖИДКОСТНОГО РАЗДЕЛЕНИЯ ФАЗ В АРХИТЕКТУРЕ ИНТЕРФАЗНОГО ЯДРАдипломная работа (Магистр)

Прикрепленные файлы