|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
УНИВЕРСАЛЬНЫЕ ДОМЕННЫЕ АРХИТЕКТУРЫ БЕЛКОВ, ИХ КОНСЕРВАТИВНОСТЬ И ЭВОЛЮЦИЯдипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Алексеевский А.В., Русинов И.С.
- Автор: Ириоглов Роман Андреевич
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2022
- Аннотация: LUCA (Last Universal Common Ancestor) – наиболее недавняя популяция организмов, от которой произошли все организмы, ныне живущие на Земле. Считается, что LUCA жил приблизительно 4,4 млрд лет назад в катархейскую (гадейскую) эру [1, 2]. Из-за того что окаменелых останков LUCA не сохранилось, его изучение возможно только путем сравнения геномов. Основной единицей эволюции белка является домен. Существуют исследования, в которых на основе распространённости белков или отдельных белковых доменов строят предположения о наличии их у LUCA, что, в свою очередь, позволяет рассуждать о его физиологии и экологии. Отдельным до конца не решённым вопросом является наличие у LUCA многодоменных белков. Хорошими кандидатами на эту роль являются многодоменные белки, широко распространённые по филогенетическому дереву. Однако распространённость не является однозначным критерием древности из-за происходящего у прокариот горизонтального переноса генов. Но если распространённая доменная архитектура является эволюционно стабильной, мы можем с большей уверенностью предполагать, что она присутствовала у предковых форм, а может быть и у LUCA. В работе составлен список универсальных доменов - доменов, встречающихся в каждом из суперцарств живой природы. Для поиска универсальных доменных архитектур на его основе была создана таблица пар универсальных доменов, встречающихся в каждом из суперцарств живой природы, т.е. универсальных пар. На первом этапе поиск универсальных архитектур производился среди доменов, образующих наибольшее количество универсальных пар. В дипломном проекта составлен список эволюционно консервативных - универсальных доменных архитектур. Четыре универсальные доменные архитектуры исследованы детально. Для двух из них предположено, что белки с такой доменной архитектурой могли присутствовать у LUCA, гипотетического организма - общего предка всех живых организмов. Для двух других универсальных доменных архитектур эволюция, восстанавливаемая по филогенетическим деревьям, может быть объяснена горизонтальными переносами или техническими причинами: неадекватными порогами сходства последовательностей для включения их в разные домена.
- Добавил в систему: Алексеевский Андрей Владимирович