|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Структура вируса мозаики альтернантеры AltMv по данным электронной микроскопиидипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Соколова О.С., Печникова Е.В.
- Автор: Седов А.C.
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2014
- Аннотация: Вирус мозаики альтернантеры (AltMV) относится к роду Potexvirus, входящему в семейство Alphaflexiviridae. Он представлен + смысловой РНК, которая упакована в белковый капсид, имеющий форму гибкой палочки ~130А в диаметре и длиной ~570нм. AltMV, также как и другие вирусы, относящиеся к роду Potexvirus, имеют огромное хозяйственное значение, являясь причиной большой части ущерба, причиняемого сельскохозяйственным культурам. Кроме того, в последние годы становится популярным направление, использующее их для разработки методов противовирусной защиты (Culver, 1996), а также диагностики вирусных заболеваний (Boonham et al., 2003) растений. Помимо этого, представители рода Potexvirus используются как модельный объект в фундаментальных исследованиях путей сайленсинга РНК, которые встречаются как у растений, так и у животных. Несмотря на наличие обширных биохимических и молекулярно-биологических данных о представителях этого рода высокую значимость потексвирусов для деятельности человека, о них накоплено относительно мало структурной информации. До сих пор не получено карт электронной плотности капсидов этих вирусов с высоким разрешением. Более того, параметры спирали для некоторых вирусов этого рода, отличаются у различных исследовательских групп (Kendall et al., 2006; Shaoqing Yang et al., 2012). В такой ситуации информация о структуре еще одного представителя рода Potexvirus, относительно недавно открытого вируса мозаики альтернантеры AltMV, будет очень полезна для понимания о и обобщения принципов организации капсидов вирусов из этого рода. Выводы 1.Получены и обработаны электронно-микроскопические изображения и определены возможные параметры спирали капсида вируса: шаг спирали – 31А, количество субъединиц на период – от 6.75 до 9.25, количество оборотов на период - 4. 2.Рассчитаны трехмерные структуры вируса мозаики альтернантеры с различным количеством субъединиц на период (6.75, 7.25, 8.75, 9.25). 3.Проведено моделирование атомной структуры вируса мозаики альтернантеры по гомологии с вирусом мозаики папайи 4.Проведен фитинг атомной структуры AltMV в полученные трехмерные структуры.
- Добавил в систему: Соколова Ольга Сергеевна