Аннотация:Понятие оперона – группы совместно транскрибируемых и регулируемых генов, – является ключевым для бактериальной генетики. За более
чем 50 лет с момента его возникновения [1] было изучено огромное количество геномов и сформулировано несколько гипотез о возможном
предназначении оперонов (см. Обзор литературы), однако существующие гипотезы не могут объяснить всего разнообразия этих загадочных
структур. В своём учебнике Genomes [2] Терри Браун приводит типичный пример необъяснённого оперона (см. Рис. 1). Составляющие его гены
кодируют белки, у которых нет очевидных причин быть совместно экспрессируемыми. Подобные примеры выявляют неполноту наших знаний об
оперонах, а также потребность в новых подходах к их изучению.
В данной работе представлен подход, связанный с
исследованием эволюции оперонов. Разработанный нами
алгоритм позволяет реконструировать, из каких генов,
вероятнее всего, состояли опероны предков современных
бактерий.