Аннотация:Целью данной работы являлось изучение механизма реакции гидролиза органофосфатов с хорошей и плохой уходящей группой фосфотриэстеразой Pd-PTE.
В данной работе для исследования реакции гидролиза органофосфатов в активном центре фосфотриэстеразой Pd-PTE использовали молекулярное моделирование с КМ/ММ потенциалами с добавлением смещающего потенциала методом зонтичной выборки (umbrella sampling).
Проведенное моделирование позволило определить механизм реакции гидролиза органофосфата фосфотриэстеразой, а также получить профили реакций гидролиза органофосфатов с хорошей и плохой уходящей группой.
