Молекулярная филогения и сиcтематика Atraphaxis L. (Polygonaceae, Polygoneae)НИР

Molecular Phylogeny and taxonomy of Atraphaxis L. (Polygonaceae, Polygoneae)

Источник финансирования НИР

грант РФФИ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 1 января 2020 г.-26 декабря 2020 г. Молекулярно-филогенетическое и сравнительно-морфологическое изучение Atraphaxis L. (Polygonaceae, Polygoneae)
Результаты этапа: В 2020 году для 48 образцов 19 видов из Средней Азии, Сибири и Забайкалья получены новые молекулярные данные по трем пластидным и одному ядерному участку, которые дают материал для новых молекулярно-морфологических публикаций. Выявлен ряд новых видов Atraphaxis (A. alaica, A. selengensis, A. kuvaevii, два криптических вида в пределах A. pungens), показана принадлежность Polygonum schischkinii к роде Atraphaxis, обнаружены случаи межвидовой гибридизации и захвата пластидной ДНК. Для всех видов, исследованных молекулярно, сделан полный морфологический анализ признаков вегетативной и генеративнйо сферы, который иллюстрирован фотографиями. Для Сибирских и Забайкальских видов составлен ключ для их определения. Для трех видов рода изучены особенности строения генеративных и вегетативных побегов и побеговых систем, соцветий, жизненных форм. Планируется продолжить морфологические исследования побеговых систем и соцветий для выявления групп родственных видов рода и выявления связи этих признаков с экологическими условиями. Для 42 образцов 21 вида исследовано анатомическое строение плодов, с особым вниманием к строению экзокарпия, различия которого позволили выявить группы родственных видов и связать особенности структуры экзокарпия с климатическими условиями, выявить анцестральный вариант и основные направления эволюции признаков экзокарпия в роде в связи с адаптацией к созреванию и прорастанию в разных климатических условиях. Планируется продолжить анатомические исследования у остальных 10 и новых видов рода. По результатам комплексных исследований в 2020 году подготовлено и сдано в печать 4 статьи объемом 30-45 страниц каждая (три на английском и одна на русском языке, но в переводной журнал), из них две статьи приняты к печати.
2 1 января 2021 г.-28 декабря 2021 г. Молекулярно-филогенетическое и сравнительно-морфологическое изучение Atraphaxis L. (Polygonaceae, Polygoneae)
Результаты этапа: В 2021 году работа велась по двум направлениям: молекулярно-филогенетическому и морфолого-анатомическому. Выделена ДНК для 70 образцов 10 видов из Южной Сибири, Монголии и Средней Азии. Для большинства образцов получены последовательности участков ядерной ДНК (nrDNA ITS1–2) и пластидной ДНК (cpDNA trnL(UAA) intron, trnL–trnF IGS, and rpl32–trnL(UAG) IGS). Проведен молекулярно-филогенетический анализ ядерных и пластидных данных и сравнительно-морфологический анализ видов и гибридов, по результатам сдана в печать статья с описанием видов из Южной Сибири и Монголии: нового вида A. kuvaevii и трех криптических видов, выделенных из A. pungens s.l. (A. pungens s.str., A. ledebourii, A. × uyukensis), имеющих разные пластидные гаплотипы и ITS-риботипы. Молекулярными и морфологическими методами показана гибридизация A. pungens и A. ledebourii с A. decipiens. Для всех молекулярно исследованных образцов и гибридов проиллюстрированы морфологические признаки, построены карты распространения пластидных гаплотипов, составлен ключ для определения видов Южной Сибири и Забайкалья. Филогенетический анализ среднеазиатских видов показал, что Atraphaxis seravschanica Pavlov и A. alaica Yurtseva sp. nov. имеют каждый два пластидных гаплотипа и два ядерных ITS риботипа, распространенных к северу и к югу от Ферганской долины. Проведено морфологическое и анатомическое исследование образцов. Готовится к публикации статья по cреднеазиатским видам рода. Исследовано анатомическое строение плода еще 10 видов рода Atraphaxis. Завершен сравнительный анализ структуры и ритма развития побеговых систем и цветорасположения у 37 видов Atraphaxis, Bactria ovczinnikovii и 4 видов Persepolium. Выявлено три варианта строения побеговых систем, которые построены на основе разных структурных элементов, выполняющих роль побегов реитерации и побегов замещения: генеративных побегов, вегетативных побегов, или тех и других. У Bactria и Persepolium основными структурными элементами являются генеративные побеги, они же рассматриваются как исходный элемент побега в роде Atraphaxis. Показаны структурные различия трех типов, их роль в определении прочих признаков побеговых систем и цветорасположения, переход от первого типа ко второму за счет недоразвития терминальных соцветий и дальнейшей специализации побегов по функциям. Выявлено распределение трех типов побеговых систем по секциям и подсекциям рода, связь с жизненными формами. Показано сходство генеративных побегов Atraphaxis и Bactria и отличия побегов Persepolium. Подготовлена и сдана в печать статья. По результатам комплексных исследований в 2021 году подготовлено и сдано в печать 3 статьи объемом 30-45 страниц (на английском языке), опубликованы 4 статьи, поданные в 2020 году. Задачи, поставленные в 2021 году по молекулярно-филогенетическим исследованиям, выполнены частично, зато задачи по анатомическому исследованию плодов и анализу побеговых систем и цветорасположения завершены полностью. В связи с этим в 2022 году для получения разрешенной филогении, планируется основное внимание уделить молекулярно-филогенетическим исследованиям видов рода Atraphaxis. Для этого необходимо получить участки rps16intron, matK для 100 образцов 40 видов Atraphaxis. Кроме этого, планируется исследовать анатомию плода еще не описанных видов и подготовить и подать в печать три статьи с результатами молекулярно-филогенетического и морфологического анализа среднеазиатских видов, нового вида Atraphaxis из Монголии и нового вида из Казахстана.
3 1 января 2022 г.-31 января 2022 г. Молекулярно-филогенетическое и сравнительно-морфологическое изучение Atraphaxis L. (Polygonaceae, Polygoneae)
Результаты этапа: В 2022 году работа велась по двум направлениям: молекулярно-филогенетическому и морфолого-анатомическому. К концу 2022 года для подавляющего большинства (47) видов рода Atraphaxis получены 6 участков cpDNA (rpl32–trnL (UAG) IGS, trnL (UAA) intron, trnL–trnF IGS, rps16 intron, matK region, psbA-trnH region). Матрица 6 пластидных участков из 174 образцов - 166 образцов 47 видов Atraphaxis и близких родов - была проанализирована методами максимальной экономии (MP) и максимального правдоподобия (ML), что позволило получить предварительную наиболее полную пластидную филогению рода Atraphaxis. На основании анализа матрицы из 280 последовательностей ITS1-5.8S-ITS2 nrDNA - 259 образцов 47 видов Atraphaxis и близких родов - была получена наиболее полная ядерная филогения рода Atraphaxis. Сопоставление пластидной и ядерной филогений показало их полную неконгруэнтность и независимое отхождение большинства субклад. Для сопоставления молекулярных и морфологических данных, для всех образцов, задействованных в молекулярном анализе, были получены фотографии репродуктивных органов, листьев и раструбов, которые были использованы при публикации новых видов и сопоставлении их с известными видами. Особое внимание было уделено строению плодов, побеговых систем и соцветий. Ранее (в 2020-2021 гг), для 30 видов видов Atraphaxis и близких родов Persepolium (5 видов) и Bactria ovczinnikovii было исследовано анатомическое строение плодов, для 37 видов Atraphaxis и близких родов было исследовано строение соцветий и побеговых систем. В 2022 году 11 признаков плодов и 15 признаков соцветий и побеговых систем были оптимизированы на пластидных филогениях рода, что позволило выявить основные пути их эволюции. Показаны гомопластические изменения состояний признаков во множестве субклад. Полученные данные создают основу для новой классификации рода. Таксономическая интерпретация полученной пластидной и ядерной филогений осложнена из-за массовых гибридизаций и преобладания сетчатой эволюции. Пластидная топология показала парафилетичность секции Tragopyrum, требующей разделения, подтвердила обособленость секции (подрода) Atraphaxis, образующей монофилетичную кладу в пластидной топологии. Секция Physopyrum, на основании группировки в пластидной и ядерной топологиях с видами секции Tragopyrum, заслуживает секционного ранга не более, чем многие другие виды. По результатам исследований в 2022 году опубликовано 4 статьи, сдана в печать еще одна (после ревизии).

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".