|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Исследование и разработка алгоритмов анализа полиморфизмов и структурных изменений в ключевых ферментах метаболизма на основе принципов системной биологии и суперкомпьютерного кодизайнаНИР
Research and development of algorithms for the analysis of polymorphisms and structural changes in key metabolic enzymes based on the principles of systems biology and supercomputer codesign
- Руководитель НИР: Швядас В.К.
- Ответственный исполнитель: Кирилин Е.М.
- Участники НИР: Жуматий С.А., Коннов С.И., Пушкарев С.В., Серов В.А., Сидоров И.Ю., Смирнов А.В., Стефанов К.С., Тихонравов А.В., Шоков В.Н.
- Подразделение: 4.08.Лаборатория параллельных информационных технологий
- Срок исполнения: 1 января 2022 г. - 31 декабря 2022 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): RE 01/22-01
- Номер ЦИТИС: 122022200255-3
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Математическое моделирование, методы вычислительной и прикладной математики и их применение к фундаментальным исследованиям в различных областях знаний и в нанотехнологиях
- Приоритеты и перспективы НТР Российской Федерации согласно Стратегии НТР РФ: переход к передовым цифровым, интеллектуальным технологиям
- ПН России: Информационно-телекоммуникационные системы
- Направление технологического прорыва России: Стратегические информационные технологии
- Критическая технология России: Технологии и программное обеспечение распределенных и высокопроизводительных вычислительных систем
-
Рубрики ГРНТИ:
- 27.35.43 Математические модели биологии
- 34.03.23 Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
-
Ключевые слова:
анализ полиморфизмов, системная биология
computer modeling, systems biology, analysis of polymorphisms -
Описание:
Исследование и разработка алгоритмов анализа полиморфизмов и структурных изменений в ключевых ферментах метаболизма
-
Abstract:
Development of algorithms for the analysis of polymorphisms and structural changes in key metabolic enzymes based on the principles of systems biology and supercomputer codesign. Identification of genetic changes that have the most significant impact on the functional properties, genotype and phenotype of encoded human proteins. Validation of the developed algorithms on the example of superfamilies of MAPK and/or PIK3/AKT signaling pathway proteins. Validation of the developed approach using computer modeling methods and experimental data and physicochemical characteristics of the analyzed objects.
-
Планируемые результаты:
Разработка алгоритмов анализа полиморфизмов и структурных изменений в ключевых ферментах метаболизма на основе принципов системной биологии и суперкомпьютерного кодизайна. Идентификация генетических изменений, оказывающих наиболее существенное воздействие на функциональные свойства, генотип и фенотип кодируемых белков человека. Валидация разработанных алгоритмов на примере суперсемейств белков сигнальных путей MAPK и/или PIK3/AKT. Валидация разработанного подхода с применением методов компьютерного моделирования и использованием экспериментальных данных и физико-химических характеристик анализируемых объектов.
-
Научный задел:
Опыт работы по высокопроизводительным методам биоинформатики, компьютерному моделированию и энзимологии в течение 20 лет
- Добавил в систему: Швядас Витаутас-Юозапас Каятоно
Источник финансирования НИР
| Хоздоговор, ИТ в медицине |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 1 января 2022 г.-31 декабря 2022 г. | Исследование и разработка алгоритмов анализа полиморфизмов и структурных изменений в ключевых ферментах метаболизма на основе принципов системной биологии и суперкомпьютерного кодизайна |
| Результаты этапа: Проведена разработка алгоритмов анализа полиморфизмов и структурных изменений в ключевых ферментах метаболизма на основе принципов системной биологии и суперкомпьютерного кодизайна; идентификация генетических изменений, оказывающих наиболее существенное воздействие на функциональные свойства, генотип и фенотип кодируемых белков человека, исследовано применение разработанных алгоритмов на примере суперсемейств белков сигнальных путей MAPK и/или PIK3/AKT, проведена валидация разработанного подхода с применением методов компьютерного моделирования и использованием экспериментальных данных и физико-химических характеристик анализируемых объектов | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".