|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Создание прототипа автоматизированной компьютерной технологии на основе биоинформатического анализа для обработки большого объема генетических данных с целью применения в персонифицированной медицинеНИР
Creation of a prototype of an automated computer technology based on bioinformatics analysis for processing a large amount of genetic data to be used in personalized medicine
- Руководитель НИР: Швядас В.К.
- Ответственный исполнитель: Панин Н.В.
- Участники НИР: Воеводин В.В., Коннов С.И., Поддъяков И.Д., Сидоров И.Ю., Шоков В.Н.
- Подразделение: 4.07.Лаборатория информатики
- Срок исполнения: 1 января 2023 г. - 31 декабря 2023 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): RE 01/23
- Номер ЦИТИС: 123030200075-1
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Фундаментальные проблемы высокопроизводительных вычислений, обработки данных и искусственного интеллекта
- Приоритеты и перспективы НТР Российской Федерации согласно Стратегии НТР РФ: переход к передовым цифровым, интеллектуальным технологиям
- ПН России: Информационно-телекоммуникационные системы
- Направление технологического прорыва России: Стратегические информационные технологии
- Критическая технология России: Технологии и программное обеспечение распределенных и высокопроизводительных вычислительных систем
- Классификатор OECD: Компьютерные и информационные науки
-
Ключевые слова:
биоинформатический анализ семейств белков, компьютерная технология, обработка генетических данных
computer technology, genetic data processing, bioinformatics analysis of protein families -
Описание:
Объединение алгоритмов анализа полиморфизмов и структурных изменений в ключевых ферментах метаболизма, а также прогнозирования лекарственной устойчивости и побочного действия лекарств в автоматизированную компьютерную технологию для обработки большого объема генетических данных с целью применения в персонифицированной медицине
-
Abstract:
Investigation of the possibilities of using protein language models, including those based on transformer models, and methods for computer prediction of the effect of genetic changes on the function of key enzymes of pathological processes. Inclusion of annotated information about structural changes in drug binding sites by human proteins in the data of genomic analysis of patients in order to identify violations of target binding and predict drug resistance in a personalized manner.
-
Планируемые результаты:
Создание прототипа автоматизированной компьютерной технологии на основе биоинформатического анализа для обработки большого объема генетических данных
-
Научный задел:
Опыт исследования взаимосвязи между структурой и функциональными свойствами ферментов, организации активных центров ферментов, опыт применения методов биоинформатики, молекулярного моделирования и высокопроизводительных вычислений в энзимологии
- Добавил в систему: Швядас Витаутас-Юозапас Каятоно
Источник финансирования НИР
| Хоздоговор, ИТ в медицине |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 1 января 2023 г.-31 декабря 2023 г. | Создание прототипа автоматизированной компьютерной технологии на основе биоинформатического анализа для обработки большого объема генетических данных с целью применения в персонифицированной медицине |
| Результаты этапа: Исследованы возможности использования моделей белкового языка, в том числе основанных на моделях трансформеров, и методов для компьютерного предсказания влияния генетических изменений на функцию ключевых ферментов патологических процессов. Проведено включение аннотированной информации о структурных изменениях в сайтах связывания лекарств белками человека в данные геномного анализа пациентов с целью выявления нарушений целевого связывания и прогнозирования лекарственной устойчивости в персонифицированном порядке. Проведено фокусированное исследование структурных нарушений белка ATM суперсемейства PIKK с использованием средств нейросетевых алгоритмов. Создан прототип автоматизированной компьютерной технологии на основе биоинформатического анализа для обработки большого объема генетических данных | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".