|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Создание экспериментальной модели определения транскриптов гена ESRIНИР
Development of an experimental model for determining ESRI gene transcripts
- Руководитель НИР: Клячко Н.Л.
- Ответственный исполнитель: Рубцова М.Ю.
- Участники НИР: Григоренко В.Г., Преснова Г.В., Уляшова М.М., Усвалиев А.Д.
- Подразделение: Кафедра химической энзимологии
- Срок исполнения: 6 июля 2023 г. - 15 декабря 2023 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 550/23
- Тип: Прикладная
- Приоритетное направление научных исследований: Живые системы, медицинские технологии, медицинская химия и новые лекарственные средства
- Приоритеты и перспективы НТР Российской Федерации согласно Стратегии НТР РФ: переход к высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения
- ПН России: Науки о жизни
- Направление технологического прорыва России: Медицинские технологии и лекарственные средства
- Критическая технология России: Биомедицинские и ветеринарные технологии
-
Рубрики ГРНТИ:
- 31.27.17 Энзимология
- 34.15.05 Методы и аппаратура в молекулярной биологии
- 34.57.21 Материалы для биомедицинского применения
- Классификатор OECD: Биохимия и молекулярная биология
-
Ключевые слова:
транскрипты, гибридизационный анализ, олигонуклеотидные зонды, онкогены
oligonucleotide probes, transcripts, oncogenes, hybridization analysis -
Описание:
Целью НИР будет создание экспериментальной мо-дели определения транскриптов гена методом твер-дофазного гибридизационного анализа в формате сэндвич, для чего будут изучены и оптимизированы условия получения модельных фрагментов транс-криптов гена, подобраны пары олигонуклеотидных зондов для их идентификации, оптимизированы ус-ловия получения комплексов транскриптов с олиго-нуклеотидными зондами и их определение методом твердофазного гибридизационного анализа.
-
Abstract:
The aim of the research will be to create an experimental model for the determination of gene transcripts by solid-phase hybridization analysis in sandwich format, for which the conditions for obtaining model fragments of gene transcripts will be studied and optimized, pairs of oligonucleotide probes for their identification will be selected, the conditions for obtaining transcript complexes with oligonucleotide probes and their determination by solid-phase hybridization analysis.
-
Планируемые результаты:
Будет изучена зависимость эффективности образования комплексов транскриптов с парами олигонуклео-тидных зондов от температуры, состава и молярности буферной смеси, структуры зондов и их взаимного расположения. Определение комплексов будет проводиться методом твердофазного гибридизационного анализа в формате сэндвич с использованием иммобилизованного стрептавидина и щелочной фосфатазы в качестве метки. Будут выбраны оптимальные условия образования комплексов для каждой пары зондов. Будет разработан протокол получения комплексов транскриптов с парами олигонуклеотидных зондов.
-
Научный задел:
Научный задел состоит в наличии опыта теоретических и экспериментальных исследований закономерностей сэндвич гибридизации ДНК бактерий с использованием пар олигонуклеотидных зондов, наличиии положительного опыта дизайна структуры таких зондов, опыта исследований по определению транскриптов генов бактерий.
-
Основные результаты:
Будет изучена зависимость эффективности образования комплексов транскриптов с парами олигонуклеотидных зондов от температуры, состава и молярности буферной смеси, структуры зондов и их взаимного расположения. Определение комплексов будет проводиться методом твердофазного гибридизационного анализа в формате сэндвич с использованием иммобилизованного стрептавидина и щелочной фосфатазы в качестве метки. Будут выбраны оптимальные условия образования комплексов для каждой пары зондов. Будет разработан протокол получения комплексов транскриптов с парами олигонуклеотидных зондов.
- Добавил в систему: Рубцова Майя Юрьевна
Источник финансирования НИР
| Хоздоговор, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля Российской академии наук (ИБХФ РАН) |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 6 июля 2023 г.-15 декабря 2023 г. | Создание экспериментальной модели определения транскриптов гена ESRI |
| Результаты этапа: Проведен анализ представленности альтернативных транскриптов гена ESR1 в базе данных NSBI, выбраны последовательности модельных транскриптов. Разработана экспериментальная модель для определения двух модельных транскриптов гена ESR1 на основе использования одноцепочечного олигонуклеотида и образцов кДНК, выделенных из биологического материала. Разработан протокол получения модельных транскриптов гена ESR1 двух размеров методами ПЦР и транскрипции in vitro. Подобраны структуры четырех пар олигонуклеотидных зондов, комплементарных структуре модельных транскриптов. Проведено изучение условий получения комплексов транскриптов с парами олигонуклеотидными зондами и разработан протокол. Оптимизированы условия определения комплексов модельных транскриптов с олигонуклеотидными зондами методом твердофазного анализа в формате сэндвич и щелочной фосфатазой в качестве метки. | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".