|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Поиск и изучение новых ингибиторов PARP на основе природных азотистых оснований, как потенциальных лекарственных соединений (НИИ ФХБ им. А.Н.Белозерского)НИР
Screening and investigation of new PARP inhibitors based on natural nitrogenous bases as potential drug compounds (Belozersky Institute)
- Руководитель НИР: Нилов Д.К.
- Ответственный исполнитель: Щербакова Т.А.
- Участники НИР: Панин Н.В.
- Подразделение: Отдел биокинетики
- Срок исполнения: 27 июня 2023 г. - 1 декабря 2025 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 23-Ш04-57
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Структура и функции биологических макромолекул и макромолекулярных комплексов. Биокатализ.
- Приоритеты и перспективы НТР Российской Федерации согласно Стратегии НТР РФ: переход к высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения
- ПН России: Науки о жизни
- Направление технологического прорыва России: Медицинские технологии и лекарственные средства
- Критическая технология России: Биомедицинские и ветеринарные технологии
-
Рубрики ГРНТИ:
- 34.15.17 Макромолекулярные ассоциации и проблемы узнавания в молекулярной биологии
- 34.15.63 Молекулярная фармакология и токсикология
- 76.03.31 Медицинская биохимия
- Классификатор OECD: Биохимия и молекулярная биология
-
Ключевые слова:
7-метилгуанин, ингибиторы parp, spfret микроскопия, азотистые основания, нуклеосомы, хроматин, молекулярное моделирование
molecular modeling, chromatin, nucleosomes, parp inhibitors, nitrogenous bases, spfret microscopy, 7-methylguanine -
Описание:
Целью проекта является изучение новых ингибиторов PARP1 на основе природных азотистых оснований, как потенциальных лекарственных соединений, с использованием комплексного подхода, сочетающего молекулярное моделирование, классический иммунохимический скрининг, а также уникальную технологию spFRET микроскопии (которая позволяет анализировать действие соединений в контексте нуклеосомы/хроматина). Для этого необходимо решить следующие задачи: (1) С помощью предварительного иммунохимического скрининга (дот-блоттинг) отобрать наиболее перспективные ингибиторы PARP1 на основе природных азотистых оснований для более детального изучения; (2) Для наиболее перспективных соединений с помощью spFRET микроскопии исследовать возможность связывания с PARP1 на уровне нуклеосомы, а также способность вызывать состояние так называемого трэппинга (образование непродуктивного комплекса PARP1-ДНК); (3) Провести детальное моделирование связывания наиболее эффективных ингибиторов в активном центре PARP1, проанализировать взаимосвязь между структурой и активностью; (4) Поскольку PARP1 обладает высокой конформационной подвижностью, необходимо исследовать важные для катализа и ингибирования конформационные состояния данного белка с помощью молекулярной динамики.
-
Планируемые результаты:
В ходе выполнения проекта планируется получить следующие результаты: Будет охарактеризована способность потенциальных ингибиторов PARP1 на основе природных азотистых оснований подавлять синтез поли(ADP-рибозы) с помощью классического иммунохимического скрининга (дот-блоттинг) в отношении рекомбинантного фермента человека (не менее 15 соединений); Для наиболее эффективных ингибиторов (не менее 4 соединений) с помощью технологии spFRET будет охарактеризована возможность связывания с PARP1 на уровне нуклеосомы, а также способность вызывать состояние трэппинга; Будут получены молекулярные модели связывания исследуемых ингибиторов в активном центре PARP1, уточнены молекулярные основы данного процесса; С помощью суперкомпьютерного моделирования структуры PARP1 будут выявлены возможные конформационные изменения, сопутствующие связыванию субстрата и ингибиторов.
- Добавил в систему: Нилов Дмитрий Константинович
Соисполнители НИР
| Кафедра биоинженерии | Соисполнитель |
Источник финансирования НИР
| Средства, выделяемые руководством Университета на обеспечение устойчивого развития Школы, Междисциплинарные научно-образовательные школы Московского университета |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 27 июня 2023 г.-31 декабря 2023 г. | Поиск и изучение новых ингибиторов PARP на основе природных азотистых оснований, как потенциальных лекарственных соединений |
| Результаты этапа: | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".