Малые некодирующие 6S РНК – регуляторы биосинтеза поверхностно-активного вещества сурфактина в клетках Bacillus subtilisНИР

Small non-coding 6S RNA as regulators of surfactant surfactin biosynthesis in Bacillus subtilis cells

Источник финансирования НИР

грант РНФ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 1 января 2024 г.-31 декабря 2024 г. Малые некодирующие 6S РНК – регуляторы биосинтеза поверхностно-активного вещества сурфактина в клетках Bacillus subtilis
Результаты этапа: В ходе изучения роли малых некодирующих 6S-1 и 6S-2 РНК в процессе биосинтеза сурфактина в клетках B. Subtilis получены следующие результаты. Методом ОТ-кПЦР проведено исследование по определеню фазы роста клеток, в которой наблюдается наибольшая разница в эффективности транскрипции гена srfAA, являющегося первым геном оперона srfA, между клетками дикого типа и с нокаутом только гена 6S-2 РНК и обоих генов 6S-1 и 6S-2 РНК. Была оптимизированы две методики полуколичественного метода определения сурфактина, основанного на фотометрическом определении изменения оптической плотности водного раствора комплекса рН-индикатора бромтимолового синего с катионным ПАВ (хлорид цетилпиридиния) при добавлении к нему раствора, содержащего сурфактин. Подобраны такие параметры проведения эксперимента, как концентрация исходных растворов бромтимолового синего и катионного ПАВ, объем и рН раствора, содержащего сурфактин. С использованием оптимизированных методов определено содержание сурфактина в культуральных жидкостях бактерий штамма B. subtilis NCIB 3610 дикого типа, без гена 6S-1 РНК, без гена 6S-2 РНК и без генов обеих 6S РНК. Разработана методика количественного метода определения сурфактина, основанного на применении обращено-фазовой ВЭЖХ. Проведено биоинформатическое сравнение геномов штаммов B. subtilis NCIB 3610 и PY79 между собой. Показано, что геном штамма PY79 помимо мутации в гене 4’-фосфопантетеинилтрансферазы (sfp), приводящей к неспособности продуцировать сурфактин, обладает протяженными участками делеций. Эти делеции не затрагивают гены, участвующие в важных для биосинтеза сурфактина процессах, однако затрагивают гены белков, участвующих в протекании негативно влияющих на биосинтез сурфактина процессах. Показано, что представленность мРНК оперона srfA в клетках штамма PY79 на 1,5 порядка выше, чем в клетках штамма NCIB 3610. Таким образом сделан вывод о том, что штамм PY79 может рассматриваться как потенциальная основа для промышленного суперпродуцента сурфактина.
2 1 января 2025 г.-31 декабря 2025 г. Малые некодирующие 6S РНК – регуляторы биосинтеза поверхностно-активного вещества сурфактина в клетках Bacillus subtilis
Результаты этапа:

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".