ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Проект направлен на разработку комплексного подхода для исследования биологических частиц на основе крио-электронной микроскопии высокого разрешения. Эта фундаментальная проблема является весьма актуальной, так как многие белки до сих пор не закристаллизованы и их атомная структура не известна. Для выявления молекулярных и структурных особенностей строения необходима методология, позволяющая получать квази-атомные структуры макромолекул на основе электронной микроскопии и молекулярного моделирования по гомологии. Эта задача имеет первостепенный приоритет в связи с разработкой современных крио-микроскопов и высокопроизводительных вычислительных кластеров. Конкретная задача исследования состоит в получении квази-атомных структур вирусных частиц с различной симметрией с использованием современных биофизических методов. Структура вирусных частиц будет изучена с помощью крио-электронной микроскопии. Отдельные изображения молекул будут собраны и классифицированы с использованием современных программ для анализа изображений. Качество классов будет оценено с помощью Фурье-преобразования. Лучшие классы, демонстрирующие наиболее четкие структурные характеристики, будут отобраны для построения реконструкции вирусной частицы. В результате будет рассчитана трехмерные структуры вирусных частиц с различной симметрией. Расшифровка структурной организации частиц будет произведена с помощью построения квази-атомных моделей, с использованием методов биоинформатики. Докинг атомных структур, полученных на основе структурной гомологии гомологии с имеющимися кристаллическими структурами, в электронную плотность будет производиться с применением современной методики «гибкого докинга». Определение квази-атомной структуры полноразмерных вирионов существенно расширит наши знания о структуре вирусных капсидов, обладающих спиральной и икосаэдрической симметрией и их взаимодействии с геномом. Эта новая информация будет иметь большое значение для понимания принципов организации вирусных частиц, что представляется весьма актуальным в связи с возможностью использования их в качестве структурных платформ для презентации эпитопов при разработке вакцин нового поколения.
грант РФФИ |
# | Сроки | Название |
1 | 1 января 2013 г.-31 декабря 2013 г. | Комплексный подход к изучению структуры вирусных частиц с различной симметрией |
Результаты этапа: | ||
2 | 1 января 2014 г.-31 декабря 2014 г. | Комплексный подход к изучению структуры вирусных частиц с различной симметрией |
Результаты этапа: | ||
3 | 1 января 2015 г.-31 декабря 2015 г. | Комплексный подход к изучению структуры вирусных частиц с различной симметрией |
Результаты этапа: |
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".