| Результаты этапа: В отчетном периоде (2011-2013) секвенировали ядерные экзоны генов RAG1, vWF, 10 экзон GHR, IRBP, 11 экзон BRCA1, BRCA2, ApoB, RAG2, интроны TTR, SPTB, THY, UTY, а также ген DBY1 и DBY7 Y-хромосомы и полную последовательность митохондриального гена cytb у представителей разных групп мелких млекопитающих: насекомоядные трех семейств (Erinaceidae, Talpidae, Soricidae); грызуны из семейства Cricetidae (п/сCricetinae) и надсемейства Dipodoidea; рукокрылые – летучие мыши сем. Vespertilionidae, род Eptesicus. Цель работы состояла в определении ядерных маркеров, адекватных для родового, видового и внутривидового уровня в разных группах мелких млекопитающих, построении молекулярных филогений и объективной оценке таксономического ранга изучаемых форм.
Для определения наиболее адекватных для филогенетических исследований генных локусов изучали характер связи между скоростью эволюции генов, уровнем гомоплазий и стабильностью нуклеотидного состава. Эта работа показала, что у насекомоядных и грызунов количество гомоплазий зависит не только и не столько от скорости мутирования последовательности, но также и от других факторов, в том числе, нестабильности нуклеотидного состава. Показано, что коэффициент гомоплазии не зависит от скорости мутирования последовательности, но достоверно положительно коррелирует со степенью стабильности нуклеотидного состава. Корреляция между скоростью эволюции и скоростью изменения нуклеотидного состава недостоверна. Из числа используемых нами ядерных генов в молекулярной филогенетике тушканчиков и насекомоядных vWF и RAG1оказывается не слишком эффективным для работы с давними дивергенциями из-за богатого CG состава и высокой скорости его изменения. В силу противоположных показателей, эффективными и надежными с точки зрения полноты и истинности филогенетического сигнала являются гены BRCAI и BRCAII.
В результате нашей работы получен абсолютно новый оригинальный материал по молекулярной филогенетике Dipodoidea, Cricetinae, Erinaceidae, Talpidae и Soricinae и предложены новые гипотезы эволюционной истории этих групп. Это определяет возможность пересмотра таксономической системы ряда изученных таксонов, в том числе тушканчикообразных, палеарктических хомяков, ежовых и кротовых мировой фауны. На основе полученных данных для перечисленных групп предложены новые системы классификации, что нашло отражение в коллективной монографии «Млекопитающие России: систематико-географический справочник».
Результаты работы решили многие систематические вопросы, связанные с оценкой таксономического ранга целого ряда насекомоядных, грызунов и летучих мышей (формы видового комплекса барабинских хомячков Cricetulus barabensis; кожаны E. bottae ognevi/E.s. anderssoni, E. bobrinskoi /E. gobiensis и E.s. serotinus/E.s. turcomanus; подвиды Hylomys suillus и таксономический ранг Hylomys megalotis; систематический статус видов и внутривидовых форм в роде Euroscaptor; взаимоотношения таксонов Pygeretmus и Allactodipus в Allactaga и др.) На основании результатов этих исследований представляется возможным разработка объективного операционального критерия вида, который опирается не только на митохондриальные и ядерные генетические дистанции, но также на времена дивергентных событий и учитывает скорость накопления мутаций. Изучение молекулярной филогении и филогеографии гладконосых летучих мышей рода Eptesicus, в эволюции которых интрогрессивные процессы происходили многократно, способствовало разработке методических приемов мультилокусного анализа филогений близкородственных и гибридизирующих видов. |
