Роль структурно-эквивалентного остатка Phe в катализе и термостабильности формиатдегидрогеназ из разных источников

Тишков, В.И.; Гончаренко, К.В.; Алексеева, А.А.; Клейменов, С.Ю.; Савин, С.С.

Авторы: Тишков В.И., Гончаренко К.В., Алексеева А.А., Клейменов С.Ю., Савин С.С.
Журнал: Успехи биологической химии
Том: 55
Год издания: 2015
Первая страница: 123
Последняя страница: 144
Аннотация: Сравнение аминокислотных последовательностей NAD+-зависимых формиатдегидрогеназ (FDH, КФ 1.2.1.2) из различных источников и структур холо-форм FDH из бактерий Pseudomonas sp.101 (PseFDH) и сои Glycine max (SoyFDH), а также апо-формы фермента из дрожжей Candida boidinii (CboFDH) указывает на наличие на поверхности белковой глобулы в структурно-эквивалентом положении гидрофобного остатка Phe. Этот остаток расположен в кофермент-связывающем домене активного центра и экранирует связанну в активном центре молекулу NAD+ от растворителя. Проведено сравнение влияния аминокислотных замен этого остатка в PseFDH, SoyFDH и CboFDH на каталитические парметры и термостабильность. Показано, что наиболее сильный эффект наблюдается в случае SoyFDH. Для этого фермента в результате всех 8 замен происходит увеличение термостабильности, а в случае 7 замен увеличивается каталитическая константа. Эффект стабилизации для замены остатка Phe на остатки Asp и Glu составил 55 и 61 раз соответственно. Константы Михаэлиса по субстратам немного уменьшались или увеличивались. В случае CboFDH в одном случае увеличивалась каталитическая константа, а термостабильность не возрастала, а в другом все было наоборот. В мутантных PseFDH в одном случае каталитическая константа не изменилась, а в трех – уменьшилась. Два мутанта PseFDH имели более высокую, а два других – более низкую термостабильность по сравнению с ферментом дикого типа. Сравнение влияния замены остатка Phe на свойства формиатдегидрогеназ из бактерий, дрожжей и растений свидетельствуют, что структура фермента играет очень важную роль при введении одних и тех же аминокислотных замен в структурно-эквивалентных положениях в разных формиатдегидрогеназах.
Добавил в систему: Тишков Владимир Иванович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ЦЭМИ РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ЦЭМИ РАН

Роль структурно-эквивалентного остатка Phe в катализе и термостабильности формиатдегидрогеназ из разных источниковстатья

Прикрепленные файлы