Exclusive sequences of different genomes

Mitrofanov, S.I.; Panchin, A.Y.; Spirin, S.A.; Alexeevski, A.V.; Panchin, Y.V.

Информация о цитировании статьи получена из Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 9 июня 2016 г.

Авторы: Mitrofanov Sergey I., Panchin Alexander Y., Spirin Sergei A., Alexeevski Andrei V., Panchin Yuri V.
Журнал: Journal of Bioinformatics and Computational Biology
Том: 8
Номер: 3
Год издания: 2010
Издательство: Imperial College Press
Местоположение издательства: United Kingdom
Первая страница: 519
Последняя страница: 34
DOI: 10.1142/S0219720010004719
Аннотация: We studied the distribution of 1-7 bp words in a dataset that includes 139 complete eukaryotic genomes, 33 masked eukaryotic genomes and coding regions from 35 genomes. We tested different statistical models to determine over- and under-represented words. The method described by Karlin et al. has the strongest predictive power compared to other methods. Using this method we identified over- and under-represented words consistent within a large array of taxonomic groups. Some of those words have not yet been described as exclusive. For example, CGCG is over-represented in CG-deficient organisms. We also describe exceptions for widely known exclusive words, such as CG and TA.
Добавил в систему: Митрофанов Сергей Игоревич

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ЦЭМИ РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ЦЭМИ РАН

Exclusive sequences of different genomesстатья

Прикрепленные файлы