|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Метод спектральной мультиэкспоненциальной аппроксимации для обработки больших массивов экспериментальных данныхстатья
- Авторы: Хрущев С.С., Плюснина Т.Ю.
- Сборник: Доклады Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика»
- Том: 7
- Год издания: 2018
- Место издания: ИМПБ РАН Пущино
- Первая страница: e34
- DOI: 10.17537/icmbb18.14
- Аннотация: Даётся подробное описание метода спектральной мультиэкспоненциальной аппроксимации и его применения для анализа кривых индукции флуоресценции хлорофилла a. Метод формализует и значительно ускоряет процедуру определения характерных времён и относительного вклада отдельных процессов в общую кинетику наблюдаемого сигнала. В основе метода лежит использование линейного разложения сигнала по базису из показательных функций с характерными временами, взятыми на фиксированной сетке. Устойчивость разложения достигается за счёт введения условия неотрицательности коэффициентов (амплитуд). Предложен удобный способ визуализации амплитуд и характерных времён для большого количества индукционных кривых в виде тепловых карт. На примере данных непрерывного мониторинга роста культуры микроводорослей Chlamydomonas reinhardtii в условиях голодания по сере показана эффективность метода для раннего выявления ответа фотосинтетического аппарата на действие стрессовых факторов. Метод может найти применение в анализе различных типов экспериментальных данных при исследовании переходных процессов разной природы.
- Добавил в систему: Хрущев Сергей Сергеевич