ХАРАКТЕРИСТИКА СТРУКТУРЫ ПРОКАРИОТНОГО КОМПЛЕКСА МНОГОЛЕТНЕМЕРЗЛЫХ ГРУНТОВ АНТАРКТИДЫ НА ОСНОВАНИИ ДАННЫХ МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИХ МЕТОДОВстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 28 июня 2016 г.
Аннотация:В образцах многолетнемерзлых грунтов Антарктиды, находящихся в природных условиях, способ- ствующих длительной (7.5 тыс. лет) “консервации” микробных сообществ, где без процедур реак- тивации не выявляются культивируемые формы (КОЕ = 0), реактивировано прокариотное мезо- фильное органотрофное сообщество, численность которого составляет 10% от общей численности микроорганизмов, определенной методами люминесцентной микроскопии. В качестве доминан- тов в прокариотном комплексе выступают группы Proteobacteria, Actinobacteria и Firmicutes. Иници- ация реактивированного микробного комплекса путем внесения в образец хитина (0.1% вес/объем) приводит к возрастанию доли метаболически активной биомассы (до 50%) за счет функционально- го доминирования хитинолитиков, что определяется целевым ресурсом. Таким образом, последо- вательное применение процедур реактивации клеток законсервированного сообщества и инициа- ции развития определенной физиологической группы, в данном случае хитинолитической, позво- лило: 1) обнаружить прокариотный комплекс, способный к реверсии метаболической деятельности (по результатам FISH); 2) определить его филогенетическую структуру методами метагеномного анализа; 3) выделить в чистую культуру доминирующий в комплексе микроорганизм с высокой хи- тинолитической активностью. Работа выполнена при поддержке гранта РНФ No 14-50-00029.
Ключевые слова: многолетнемерзлые грунты, Антарктида, метагеномный анализ, гибридизация кле- ток in situ (FISH), метаболически активный прокариотный комплекс.