ГИПОТЕТИЧЕСКИЕ SNP-МАРКЕРЫ, ЗНАЧИМО ИЗМЕНЯЮЩИЕ ОЦЕНКИ СРОДСТВА ТАТА-СВЯЗЫВАЮЩЕГО БЕЛКА К ПРОМОТОРАМ ОНКОГЕНОВ VEGFA, ERBB2, IGF1R, FLT1, KDR И MET – МИШЕНЕЙ ДЛЯ ХИМИОТЕРАПИИстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 11 апреля 2019 г.
Аннотация:Предложена гипотеза, согласно которой “ЕСЛИ некоторый SNP может статистически значимо увеличивать экспрессию онкогена, повышая сродство ТАТА-связывающего белка (ТВР) к его промотору, ТО этот SNP может также ослабить кажущуюся биоактивность ингибиторов этого онкогена при противоопухолевой химиотерапии, et vice versa”. При помощи предложенного ранее метода (http://beehive.bionet.nsc.ru/cgi-bin/mgs/tatascan/start.pl) в рамках этой гипотезы оценили все SNP в районе [–70; –20], в котором расположены все известные сайты связывания ТВР, в промоторах онкогенов VEGFA, EGFR, ERBB2, IGF1R, FLT1, KDR и MET, представленные в референсной версии генома человека, hg19. Влияние 83% из этих SNP на сродство ТВР к промоторам для сборки предынициаторных комплексов статистически незначимо. Гипотетически такими маркерами ослабления кажущейся активности ингибиторов этих онкогенов могут быть rs36208385, rs36208384, rs370995111, rs372731987, rs111811434, rs369547510, rs76407893, rs369728300 и rs72001900, а усиления – rs141092704, rs184083669, rs145139616, rs200697953, rs187746433, rs199730913, rs377370642, rs114484350, rs374921120, rs146790957, rs376727645 и rs72001900.