|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Протеомный анализ мха Physcomitrella patens (Hedw.) B.S.Gстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАКСтатья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 24 января 2020 г.
- Авторы: Скрипников А.Ю., Поляков Н.Б., Толчева Е.В., Великодворская В.В., Долгов С.В., Демина И.А., Рогова М.А., Говорун В.М.
- Журнал: Биохимия
- Том: 74
- Номер: 5
- Год издания: 2009
- Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 593
- Последняя страница: 606
- Аннотация: Для построения референтной протеомной карты мха Physcomitrella patens, основанной на полной нуклеотидной последовательности генома, проведены двумерные электрофорезы белков, изолированных из протопластов, протонемы и гаметофоров мха. На гелях, обработанных серебром, разрешено в зависимости от фазы развития мха от 500 до 600 белковых пятен. Анализ пептидов, полученных в результате трипсинолиза белков, методом MALDITOFмассспектрометрии («пептидного отпечатка») позволил идентифицировать 212 индивидуальных белков. В целях расширения спектра изучаемых белков проведен одномерный гель-электрофорез белков экстракта в денатурирующих условиях с последующим анализом триптических пептидов методом LCESIMS/MS. С помощью предложенного метода определено еще 186 белков. Применительно к 398 белкам, идентифицированным двумя методами, проведена классификация в соответствии с системой кластеризации ортологичных генов. Установлено, что 16% белков участвуют в различных клеточных процессах и передаче сигнала, 26% – в процессах метаболизма, 7% – в процессинге и хранении генетической информации. В результате протеомного анализа с использованием флуоресцентных красителей,конъюгированных с белками в тотальных препаратах, обнаружены различия между двумя основными фазами жизненного цикла мха – протонемой и гаметофорами. Выявлены достоверные различия в белковом спектре протопластов, изолированных из протонемы, – они существенно отличаются по составу белков как от протонемы, так и от гаметофоров. КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: протеомика, 2Dэлектрофорез, MALDITOF, LCESIMS/MS, Physcomitrella patens, протопласты, DiGE.
- Добавил в систему: Скрипников Александр Юрьевич