|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Сравнение квантово-классической модели фотоизомеризации родопсина с квантовомеханическим подходом Хан–Стокастатья
- Авторы: Шигаев А.С., Фельдман Т.Б., Надточенко В.А., Лахно В.Д.
- Сборник: Доклады Международной конференции “Математическая биология и биоинформатика”. Под ред. В.Д. Лахно.: Статья № e5
- Том: 7
- Год издания: 2018
- Место издания: ИМПБ РАН г. Пущино, Московской обл
- Первая страница: 1
- Последняя страница: 5
- DOI: 10.17537/icmbb18.59
- Аннотация: Проведён сравнительный анализ возможностей двух упрощённых математических моделей цис-транс фотоизомеризации хромофора (ретиналя) в родопсине: квантово-классического подхода и модели Хан–Стока. Квантово-класcический подход, включающий три вибронных состояния, разработан нашей группой ранее. Квантовая подсистема состоит из: (i) основного состояния молекулы родопсина, (ii) возбуждённого состояния и (iii) первичного фотопродукта в основном состоянии. Классическая подсистема включает одинаковые точечные массы; их отклонение от равновесных положений регулируется упругими константами. В традиционной квантовомеханической модели Хан–Стока, включающей два состояния, в качестве переменных взяты коллективная координата реакции и продольные колебательные моды системы двойных связей. Проведены численные исследования квантово-классической модели. Продемонстрирована ключевая роль коэффициента трения. Показано, что наилучшее соответствие экспериментам наблюдается тогда, когда диссипация основной части избыточной энергии фотовозбуждения совпадает по времени с элементарным актом фотореакции. Такой "силовой барьер" очень трудно учесть в квантовомеханическом подходе Хан–Стока. Таким образом, квантово-классическое моделирование открывает большие возможности в плане исследований механизма фотореакции в родопсине.
- Добавил в систему: Фельдман Татьяна Борисовна