|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Механохимическое расщепление ДНК и свойства регуляторных участков геноматезисы доклада
- Авторы: Нечпуренко Ю.Д., Урошлев Л.А., Абдулаев Э.Т., Ходыков М.В., Полозов Р.В., Панченко Л.А., Ильичева И.А.
- Сборник: Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019)
- Том: 1
- Тезисы
- Год издания: 2019
- Место издания: ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар
- Первая страница: 120
- Последняя страница: 121
- DOI: 10.31429/SbR6.2019.001
- Аннотация: При облучении молекул ДНК ультразвуком происходят двуцепочечные разрывы её нитей, причем относительные частоты разрывов в фрагментах ДНК зависят как от типа динуклеотида, в котором происходит разрыв, так и от окружающих нуклеотидных последовательностей. Анализ экспериментальных данных позволил нам ранее получить частоты разрывов в каждом из 16-ти динуклеотидов. Обнаружено, что межнуклеотидные связи, следующие за цитозином, расщепляются чаще, чем другие. Частоты расщепления убывают в ряду d(CpG) > d(CpA) > d(CpT) >> d(CpC). При подготовке образцов для секвенирования нового поколения (NGS) в ДНК тоже происходят двуцепочечные разрывы. Анализ данных по фрагментации геномной ДНК, которая проводится при помощи различных механохимических методов, даёт соотношения частот расщепления, близкие к полученным нами ранее экспериментально. Различие частот расщепления в разных позициях нуклеотидной последовательности ДНК связано с механохимическим механизмом её расщепления. и свидетельствует о локальных характеристиках двойной спирали ДНК. Мы предложили использовать для анализа локального конформационного состояния ДНК ряд параметров (индексов), характеризующих расщепление ДНК по разным нитям.
- Добавил в систему: Панченко Лариса Андреевна