|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Механохимическое расщепление ДНК как инструмент анализа функциональных участков геномастатья
- Авторы: Ильичева И.А., Панченко Л.А., Урошлев Л.А., Абдуллаев Э.Т., Ходыков М.В., Полозов Р.В., Нечипуренко Ю.Д.
- Журнал: Обозрение прикладной и промышленной математики
- Том: 26
- Номер: 4
- Год издания: 2019
- Издательство: Научное издательство «ТВП»
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 254
- Последняя страница: 262
- Аннотация: Позиции разрывов межнуклеотидных связей считали случайными, не зависящими от последовательности нуклеотидов. Поэтому ультразвук широко использовали в методиках NGS-секвенирования геномных ДНК. С.Л. Гроховский предпринял более детальные исследования процессов ультразвукового расщепления ДНК [7]. Оказалось, что ультразвуковая фрагментация ДНК происходит не случайным образом, а специфично к последовательности нуклеотидов. На интенсивность ультразвукового расщепления межнуклеотидной связи влияет как тип динуклеотида, так и его соседи (нуклеотидный контекст). О причине этого явления в работе [9] мы смогли высказать предположение после того, как провели детальный анализ имеющихся в литературе ЯМР-исследований конформационного поведения малых фрагментов ДНК, а также многочисленных рентгеноструктурных работ и конформационных расчетов. Итак, с уверенностью можно сказать, что нуклеотидная последовательность в промоторных областях геномов характеризуется такими свойствами, которые способствуют перестройкам пространственной структуры двойной спирали при связывании регуляторных белков и облегчают последующее формирование так называемого "открытого комплекса", необходимого для транскрипции.
- Добавил в систему: Панченко Лариса Андреевна