|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Использование метода ПЦР для обнаружения возбудителя ризоктониоза в растительном материалестатья
- Авторы: Кокаева Л.Ю., Ярмеева М.М., Зейрук В.Н., Еланский С.Н.
- Сборник: Сохраняя традиции – к новым достижениям: научная конференция, посвященная памяти ведущих ученых в области почвенной микробиологии И. Ю. Чернова, М. М. Умарова, О. Е. Марфениной, Б. А. Бызова: 25 декабря 2019 г.: Тезисы докладов / Сост. Л. А. Поздняков
- Редактор: Поздняков Лев Анатольевич
- Год издания: 2019
- Место издания: МАКС Пресс Москва
- Первая страница: 33
- Последняя страница: 34
- Аннотация: Почвообитающий гриб Rhizoctonia solani вызывает заболевание клубней картофеля – ризоктониоз. Заболевание проявляется в виде черных склероциев на поверхности клубня (парша), углубленной (ямчатой) пятнистости и сетчатого некроза клубней, загнивания глазков и ростков, отмирания столонов и корней, а также в виде сухой гнили подземной части стебля в виде коричневых язв различной величины и «белой ножки» стеблей. Высокая вариабельность патогена позволяет ему адаптироваться к поражению разных сортов и даже видов растений, а также к применяемым против него фунгицидам. Внутри вида R. solani выделяют 13 анастомозных групп (АГ). Поражение картофеля и томата вызывают преимущественно представители группы АГ-3. Принадлежность к анастомозной группе определяют методом попарного сращивания с тестерными штаммами, по сиквенсу последовательности ITS, а также с помощью специфичных ПЦР праймеров. В нашей работе последовательности ITS были определены у 58 штаммов, выделенных из клубней, собранных в разных регионах России, а также из импортированного немецкого картофеля. Были выявлены 2 штамма из клубней картофеля, выросших в Смоленской и Московской областях, принадлежащие к группе АГ-5. Эти штаммы отличались высокой агрессивностью к картофелю и устойчивостью к пенцикурону. Все остальные изученные штаммы с клубней картофеля принадлежали к группе АГ-3. ДНК части изученных с помощью секвенирования ITS штаммов также амплифицировали со специфичными для группы АГ-3 праймерами PT1 GTTTGGTTGTAGCTGGTCT-3' и PT2 CTGAGATCCAGCTAATAC-3' (Keiser, 2007). Продукт ПЦРамплификации имел длину около 400 п.н., наличие фрагмента на электрофореграмме позволяло отнести штамм к группе АГ-3. Результаты ПЦР-анализа полностью совпали с анализом, проводимым с помощью секвенирования. Амплификация продукта ожидаемого размера была также обнаружена у ДНК, выделенной из ткани картофеля с низким уровнем (менее 1 склероций на см2 ) и высоким уровнем (10 и более склероциев на см2 ). Данный метод может быть использован для успеш33 ной детекции возбудителя ризоктониоза картофеля, принадлежащего к группе АГ-3, из тканей клубня без выделения чистых культур
- Добавил в систему: Еланский Сергей Николаевич