Аннотация:Представители семейства Карповых характеризуются сложной картиной полиплоид-ности, образованием сложных гибридов и хромосомными перестройками [1]. Показано,что в генах, кодирующих активно отбираемый в ходе селекции признак, длина короткихтандемныхповторов(SSR)можеткоррелировать(втомчислеколичественно)свыражен-ностьюкодируемогопризнака[2].СпособностьSSRкэкспансиямисокращениямсвязанас изменением скорости мутационного процесса ДНК [3].В работе рассмотрены полные наборы SSR 28 рыб семейства карповых, полученныхизбазыданныхFishMicrosat[4].ДлянаборовSSRпроведенстатистическийанализразме-ров и нуклеотидной последовательности. Для каждого набора рассчитана удельная пред-ставленность олигонуклеотидов (ди-, три- и тетра-) и проведен иерархический кластер-ный анализ. Полученные в результате два кластера хорошо согласуются с тем, разводят-ся ли соответствующие виды в неволе. При анализе и соответствующей визуализациис помощью метода главных компонентов (PCA) первичной структуры соответствующихим SSR выявлено, что включающий большинство культивируемых рыб кластер отличаетбольшее количество TG-(CA-)богатых последовательностей при его обеднении AG-(TC-)динуклеотидами.Таким образом, разведение представителей Cyprinidae в неволе коррелирует с преоб-ладанием пар TG; такие рыбы склонны иметь единичные повторы, превосходящие дли-ной большинство других SSR. Кластеризация частоты встречаемости олигонуклеотидовв наборах SSR успешно выделила две группы - дикие/разводимые рыбы.
