|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Биоинформатический анализ структурных взаимосвязей в удаленных гомологах суперсемейства альфа-бета гидролазстатья
- Авторы: Шаповалова И.В., Панин Н.В., Тахавеев В.А., Мисюра Н.М., Суплатов Д.А.
- Журнал: Современные проблемы науки и образования
- Номер: 6
- Год издания: 2012
- Издательство: Общество с ограниченной ответственностью "Издательский Дом "Академия Естествознания"
- Местоположение издательства: Пенза
- Аннотация: Ферменты одного семейства, обладая общей каталитической стратегией, могут различаться по другим свойствами и разделяться на подсемейства по субстратной специфичности, стереоселективности, стабильности и т.д. Сравнительный биоинформатический анализ был применен для изучения таких позиций в структурах белков, специфическая изменчивость которых в рамках семейства позволяет предположить их ведущую роль в формировании функционального разнообразия. Такие специфические позиции подсемейства (СПП) консервативны только внутри подсемейств ферментов, но различаются между ними. Алгоритм поиска СПП в структурах белков на основе геномной и структурной информации был использован для биоинформатического анализа ферментов суперсемейства альфа-бета гидролаз, которые потеряли сходство по аминокислотным последовательностям в результате естественного отбора и эволюции от общего предка. Проведенное исследование показало высокую степень структурного сходства активных центров даже у удаленных гомологов и выявило закономерности распределения типов аминокислот у ферментов с различными каталитическими свойствами.
- Добавил в систему: Суплатов Дмитрий Андреевич