|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Analysis of RNA binding properties of human Ku protein reveals its interactions with 7SK snRNA and protein components of 7SK snRNP complexстатья Исследовательская статья
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 20 мая 2020 г.
- Авторы: Shadrina Olga, Garanina Irina, Korolev Sergey, Zatsepin Timofei, Assche Jeanne Van, Daouad Fadoua, Wallet Clementine, Rohr Olivier, Gottikh Marina
- Журнал: Biochimie
- Номер: 171-172
- Год издания: 2020
- Издательство: Elsevier BV
- Местоположение издательства: Netherlands
- Первая страница: 110
- Последняя страница: 123
- DOI: 10.1016/j.biochi.2020.02.016
- Аннотация: Гетеродимерный белок Ku человека, состоящий из субъединиц Ku70 и Ku80, играет важную роль в репарации двуцепочечных разрывов по пути негомологичного объединения концов в качестве сенсора двухцепочечных разрывов ДНК. Ku также участвует в многочисленных клеточных процессах, и в некоторых из них он действует РНК-зависимым образом. Однак РНК-связывающие свойства человеческого Ku недостаточно изучены. В данной работе мы проанализировали взаимодействие рекомбинантного гетеродимера Ku с набором РНК различной структуры, а также данные eCLIP для Ku70 человека. В результате мы предложили консенсусную структуру РНК, предпочтительную для связывания Ku, которая представляет собой шпильку с выпетливанием рядом с концевой петлей, содержащей GpG-последовательность. 7SK РНК образует клеточный рибонуклеопротеиновый комплекс 7SK мяРНП, который, как известно, участвует в регуляции транскрипции. Мы показали, что рекомбинантный Ku специфически связывает G-богатую петлю шпильки 1 внутри 7SK мяРНК. Кроме того, белок Ku был со-осажден из клеток HEK 293T с эндогенной 7SK мяРНК и такими белками, включенными в 7SK мяРНП, как HEXIM1, Cdk9 и CTIP2. Обнаружено, что связывание Ku и Cdk9 не зависит от РНК, в то время как совместное осаждение HEXIM1 и Ku зависит от наличия интактной 7SK мяРНП. Последний результат был подтвержден с использованием рекомбинантных белков HEXIM1 и Ku. Колокализация Ku и CTIP2 была дополнительно подтверждена конфокальной микроскопией. Эти результаты позволяют нам предложить Ku в качестве нового компонента комплекса 7SK мяРНП.
- Добавил в систему: Шадрина Ольга Алексеевна