Структурная организация и динамические характеристики участка связывания ингибиторов конформационной перестройки гемагглютинина вируса гриппа H3N2 и H7N9статья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 21 октября 2020 г.
Аннотация:Для исследования структурной организации и динамических характеристик участка связывания ингибиторов конформационной перестройки белка разработаны компьютерные модели гемагглютинина вирусов гриппа H3N2 и H7N9. Использование метадинамики позволило составить карту свободной энергии данных участков и установить объемы их наиболее энергетически выгодных состояний. При молекулярном моделировании взаимодействия умифеновира (арбидола) с гемагглютинином показано, что для связывания лиганда необходимо увеличение объема и деформация энергетически наиболее выгодного состояния участка связывания ингибиторов конформационной перестройки. Идентифицированы аминокислотные остатки, непосредственно участвующие в связывании ингибитора и определяющие эффективность взаимодействия, а также динамическое поведение участка связывания ингибиторов конформационной перестройки гемагглютинина. Выявленные свойства и особенности структурной организации участка связывания ингибиторов конформационной перестройки гемагглютинина вируса гриппа необходимо учитывать при поиске новых противовирусных препаратов, способных модулировать его функциональные свойства.