Аннотация:В работе описан новый подход к построению 3d дескрипторов молекулярных графов для решения задач «структура-свойство» и «структура-активность. Дальше в статье они называются «MS-дескрипторы» (Molecular Surface descriptors). MS-дескрипторы основаны на описании молекулы парами и тройками особых точек, классифицированных по расстоянию между друг другом, и значениях физико-химических свойств в этих точках. MS-дескрипторы учитывают геометрию молекулярной поверхности и ее локальные физико-химические свойства, основанных на описании молекулы набором «особых точек». Проект реализован в системе MatlabR2008а и на языке С++. Проведены вычислительные эксперименты на выборках молекул гликозидов и токсичных соединений.