ВЛИЯНИЕ ВЯЗКОСТИ СРЕДЫ НА МОЛЕКУЛЯРНУЮ ДИНАМИКУ ФОРМИРОВАНИЯ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ ПОЛИПЕПТИДОВ (AlaGly)25 И (AlaGly)75

Эрендженова, А.А.; Армеев, Г.А.; Шайтан, К.В.

Авторы: Эрендженова А.А., Армеев Г.А., Шайтан К.В.
Журнал: Биофизика
Том: 65
Номер: 5
Год издания: 2020
Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
Местоположение издательства: Москва
Первая страница: 860
Последняя страница: 864
DOI: 10.31857/S0006302920050026
Аннотация: Методами ланжевеновской динамики при различных значениях вязкости виртуальной среды изучен фолдинг модельных полипептидных последовательностей, состоящих из 50 и 150 аминокислот- ных остатков с чередованием аланина и глицина. Стартовые конформации соответствовали полно- стью развернутой структуре цепи. Изменение диссипативных свойств среды моделировалось за счет вариации параметров ланжевеновского термостата. Показано, что имеется достаточно высокая и пороговая чувствительность результата сворачивания цепи к вязкости среды. Сворачивание рас- смотренных полипептидных последовательностей при вязкости среды уже порядка вязкости сжиженных газов происходит преимущественно в альфа-спиральные конформации. При уменьшении эффективной вязкости среды ниже критической происходит формирование неупорядоченных структур. Обращает внимание, что в условиях виртуальной среды энергетические эффекты не являются однозначным критерием для определения конформации в результате сворачивания полипеп- тидной цепи. Наблюдаемые эффекты вязкости, приводящие к корреляции конформационных движений за счет действия диссипативных сил и отбору возможных путей конформационной релаксации цепи, непосредственным образом влияют на результат сворачивания в соответствии с предсказаниями аналитической теории.
Добавил в систему: Шайтан Константин Вольдемарович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ЦЭМИ РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ЦЭМИ РАН

ВЛИЯНИЕ ВЯЗКОСТИ СРЕДЫ НА МОЛЕКУЛЯРНУЮ ДИНАМИКУ ФОРМИРОВАНИЯ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ ПОЛИПЕПТИДОВ (AlaGly)25 И (AlaGly)75статья Исследовательская статья

Прикрепленные файлы