Математические методы прогнозирования противоопухолевой активности

Прохоров, Е.И.; Апрышко, Г.Н.; Пугачева, Р.Б.; Беккер, А.В.; Перевозников, А.В.; Кумсков, М.И.

Авторы: Прохоров Е.И., Апрышко Г.Н., Пугачева Р.Б., Беккер А.В., Перевозников А.В., Кумсков М.И.
Сборник: XX российский национальный конгресс «Человек и Лекарство»: Сборник материалов конгресса
Тезисы
Год издания: 2013
Место издания: ЗАО РИЦ «Человек и лекарство» Москва
Первая страница: 415
Последняя страница: 415
Аннотация: Цель: оценка применимости методов поиска количественных соотношений «структура – свойства» для прогнозирования противоопухолевой активности. Материалы и методы: для анализа была использована выборка соединений различных химических классов, извлеченная из Базы данных по противоопухолевым веществам РОНЦ им. Н.Н. Блохина РАМН, для которых экспериментально показано наличие или отсутствие противоопухолевой активности. Обучающая часть выборки, содержащая 359 активных и 423 неактивных соединений, использована для построения методами QSAR на базе современного математического аппарата теории распознавания образов моделей, способных прогнозировать активность ещё неизученных соединений. Прогноз осуществ-лялся для 101 соединения контрольной выборки. Результаты: проведено сравнение результатов эксперимента на различных множествах моделей «структура – свойство»: регрессионных, моделей на базе модифицированного метода k ближайших соседей с ограничением по радиусу и метода опорных векторов с использованием ядер. При построении моделей использовался эволюционный отбор фрагментных дескрипторов. Предъявлен набор моделей, дающих 64,36% верных прогно-зов на контрольной выборке соединений. При этом количество ложноположительных и ложноотрицательных прогнозов составило 11,88% и 23,76% от общего числа контрольных соединений соответственно. Также установлен метод поиска наиболее перспективных в смысле изучаемой активности соединений, с помощью которого получен набор соединений, из которых 71,43% оказались активными. Результаты также сравнивались с прогнозами, полученными с помощью системы прогнозирования биологической активности PASS (Prediction of Activity Spectra for Substances). Сравнение показало, что предложенный в работе подход на данной контрольной выборке соединений демонстрирует результаты лучшие, нежели система PASS, как по числу верно предсказанных соединений, так и по количеству ложноположительных и ложноотрицательных прогнозов. Выводы: предложенные методы и модели могут быть использованы для решения задачи прогнозировании противоопухолевой активности химических соединений.
Добавил в систему: Прохоров Евгений Игоревич

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ЦЭМИ РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ЦЭМИ РАН

Математические методы прогнозирования противоопухолевой активноститезисы доклада

Прикрепленные файлы