|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Использование классификатора «случайный лес» для определения токсического действия тяжёлых металлов на растения гороха Pisum sativum и фитопланктонтезисы доклада
- Авторы: Червицов Р.Н., Тодоренко Д.А., Дрозденко Т.В., Хрущев С.С., Антал Т.К., Плюснина Т.Ю.
- Сборник: АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ. БФФХ-2021: Материалы ХVI международной научной конференции г. Севастополь, 13-17 сентября 2021 г
- Тезисы
- Год издания: 2021
- Первая страница: 90
- Последняя страница: 90
- Аннотация: Благодаря активному развитию технических возможностей для получения экспериментальных данных объем таких данных значительно вырос. Для анализа большого массива данных необходимо развитие методов их анализа, в связи с этим методы машинного обучения находят все большее применение. В работе исследуется действие токсикантов на фотосинтетический аппарат растений и фитопланктона. В задачу работы входило построение и обучение классификатора для выявления действия токсиканта по параметрам кривой индукции флуоресценции хлорофилла a. Форма кривой индукции флуоресценции меняется в зависимости от состояния растительного организма и может служить индикатором действия факторов стресса. Изменение состояния фотосинтетического аппарата может быть вызвано наличием в среде выращивания факторов стресса (в том числе токсикантов).Исследовали действие тяжёлых металлов на проростки гороха и пробы природного фитопланктона. Проростки гороха Pisum sativum инкубировали на среде Кнопа с добавлением ионов меди Сu2+ в концентрации 20 и 40 мкМ или ионов кадмия Сd2+ (20 и 50 мкМ), пробы природного фитопланктона из девяти водоёмов Псковской области инкубировали при добавлении Сd2+ или Сr6+ (20 и 50 мкМ). На протяжении всего периода эксперимента (несколько суток) регулярно проводилась регистрация кривых индукции флуоресценции листьев гороха и проб с фитопланктоном. По кривым индукции флуоресценции были рассчитаны параметры JIP-теста, которые затем были использованы для построения классификаторов типа «случайный лес». Задача данных классификаторов – выявление наличия или отсутствия токсиканта в пробе. В случае классификаторов для проростков гороха общая точность составила 67% для меди Сu2+ и 78% для кадмия Сd2+. Точность определения контрольных проб без токсиканта оказалась ниже, чем для проб с токсикантом. В случае классификатора для фитопланктона общая точность составила 88%. Точность определения в разных водных объектах различается: в отдельных местообитаниях точность составляла менее 50%, а в других точность оказалась близка к 100%. Согласно полученным результатам, существуют перспективы применения данного метода при определении наличия токсикантов, в том числе в естественных местообитаниях.
- Добавил в систему: Хрущев Сергей Сергеевич