Связь между содержанием сильнодивергировавших повторяющихся последовательностей ДНК и типом организации генома у эукариотстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 26 декабря 2017 г.
Аннотация:Проведена экспериментальная проверка предположения о едином принципе линейной организации повторяющихся и уникальных последовательностей в геномах эукариот. Предположение основано на гипотезе, согласно которой уникальный компонент в так называемом коротком периоде чередования представлен сильно дивергировавшими повторами. В таком случае геномы с противоположными типами организации ("Дрозофильным" и "Ксенопусным") должны различаться по содержанию сильнодивергировавших повторов, которое можно оценить профилем плавления повторяющейся ДНК после реассоциаци в мягких условиях. Результаты соответствующих опытов показали, что короткий период чередования, обнаруживаемый в стандартных опытах по изучению организации геномов эукариот, в действительности представляет собой блок коротких повторяющихся единиц, различающихся по уровню внутригеномной дивергенции. Предложена общая модель организации геномов эукариот: блоки повторяющихся последовательностей длиной несколько тысяч нуклеотидов чередуются с уникальными последовательностями большой протяженности (до 10000 нуклеотидов). Различия типов организации сводятся к различиям степени внутригеномной дивергенции элементарных повторяющихся единиц. Согласно модели, все разнообразие типов геномов сводится к универсальному типу чередования блоков гетерогенных по степени дивергенции повторов с длинными уникальными последовательностями.