Аннотация:Разработана методика выявления РНК вируса SARS-CoV-2 в биологическом материале (смывах со слизистой, суспензиях органов) от животных на основе ОТ-ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации в режиме «реального времени». Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентные зонды подобраны на основе анализа выравниваний нуклеотидных последовательностей вируса, представленных в международных базах данных, для амплификации генов Е и N. Оценена специфичность методики при тестировании разного материала от животных. Чувствительность методики варьировала от 5х102 копий/мл до 1х103 коп/мл. Проведены исследования более 180 образцов биологического материала от различных животных: собак, кошек, норок. РНК вируса SARS-CoV-2 выявлена у двух кошек – результаты совпали при параллельном исследовании этих образцов с использованием тест-системы GeneFinder COVID-19 Plus RealAmp Kit (Корея). Известно, что один из положительных образцов был отобран от кошки с признаками респираторного заболевания, у хозяина которой ранее была зафиксирована инфекция COVID-19. К сожалению, нет данных о наличии или отсутствии клинических признаков заболевания у второго животного.
Проведенный анализ нуклеотидной последовательности участка гена N вируса размером 232 п.н. с использованием подобранных специфичных праймеров, фланкирующих этот фрагмент, показал 100 % идентичность анализируемого фрагмента из образцов материала от кошек последовательностям гена N изолятов SARS-CoV-2, выделенного в 2020 году от человека.