ДНК «минимальных» клеток (микоплазм) в метагеномах вечной мерзлотыстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 21 августа 2017 г.
Аннотация:В вечной мерзлоте в течение длительного геологического времени могут сохраняться ферменты, нуклеиновые кислоты, вирусы и жизнеспособные микроорганизмы. Сложно получить целостное представление о микробном сообществе многолетнемерзлых толщ, используя только классические микробиологические методы. Анализ метагеномов вечной мерзлоты позволил обнаружить генетичекий материал древних микоплазм – патогенов человека, животных и растений. Отбор образцов, выделение тотальной ДНК из почвы, секвенирование (Illumina), обработка метагеномных данных (MG-RAST, M5nr, uniProt, Krona). Предсказан видовой состав микоплазм в почвенных образцах многолетнемерзлых отложений Арктики различного происхождения, но сопоставимого возраста (31–32 тыс. лет). Выполнен сравнительный анализ коротких полипептидов, кодируемых фрагментами древней ДНК, с участками белков современных микоплазм. Обсуждаются филогенетическая история Mollicutes, пластичность их генома и патогенный потенциал вечной мерзлоты.