|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Изучение филогенетического разнообразия бактерий цикла серы в прибрежных донных осадках Чёрного морятезисы доклада
- Авторы: Власова М.А., Брюханов А.Л., Перевалова А.А., Малахова Т.B., Пименов Н.В.
- Сборник: Сборник тезисов 21-й Международной Пущинской школы-конференции молодых учёных БИОЛОГИЯ - НАУКА XXI ВЕКА
- Тезисы
- Год издания: 2017
- Место издания: Пущино
- Первая страница: 13
- Аннотация: Чёрное море – один из крупнейших меромиктических водоёмов, в донных осадках которого протекает мощнейший процесс образования сероводорода, биогенная природа которого на данный момент подтверждена полностью. Несмотря на это, к настоящему времени еще не было проведено серьезных исследований филогенетического разнообразия сульфатредуцирующих бактерий (СРБ) в донных отложениях, хотя изучение сульфатредукции, а также сопряженного с ней процесса окисления серы и вовлеченных в них микроорганизмов, несомненно, остается одним из ключевых векторов изучения морских экосистем в целом, и Черного моря, в частности. Целью данной работы было получение данных о филогенетическом разнообразии бактерий цикла серы, обитающих в прибрежных донных осадках Чёрного моря. Донные образцы отбирали в Голубой бухте Чёрного моря (г. Севастополь) с глубины 5 м в августе 2015 г. из белёсых бактериальных матов сульфурет, а также из верхнего слоя близлежащего донного осадка в качестве контроля. С ДНК из нативных проб и полученных нами накопительных культур был проведён ПЦР-анализ с использованием олигонуклеотидных праймеров, специфичных к участкам генов (reductive dsrB, oxidative dsrB), кодирующих β-субъединицу диссимиляционной (би)сульфитредуктазы – ключевого фермента цикла серы, присущего сульфатредуцирующим и сероокисляющим бактериям. Полученные ПЦР-продукты разделяли посредством денатурирующего градиентного гель-электрофореза (DGGE), определяли их нуклеотидные последовательности и проводили филогенетический анализ с помощью программных пакетов BLAST и MEGA. Было показано, что по аминокислотным последовательностям, кодируемым геном dsrB, сульфатредуцирующие бактерии, обнаруженные нами в донных осадках Черного моря, имели наибольшую гомологию (92-99%) с геном dsrB культивируемых СРБ родов Desulfovibrio, Desulfatitalea, Desulfobacter, Desulfobacterium, а также с некультивируемыми штаммами СРБ из различных морских местообитаний, таких как морские осадки Северного и Японского морей. Аминокислотные последовательности, кодируемые геном oxidative dsrB, обладали наибольшей гомологией (90-99%) к соответствующему гену представителей родов Thiocapsa, Thiobaca, Thioflavicoccus и Thiorhodococcus.
- Добавил в систему: Брюханов Андрей Леонидович