|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Expression of hairpin-enriched mitochondrial DNA in two hairworm species (Nematomorpha)статья Исследовательская статья Электронная публикация
Статья опубликована в высокорейтинговом журнале
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 20 февраля 2024 г.
- Авторы: Nikolaeva O.V., Beregova A.M., Efeykin B.D., Miroliubova T.S., Zhuravlev A.Yu, Ivantsov A.Yu, Mikhailov K.V., Spiridonov S.E., Aleoshin V.V.
- Журнал: International Journal of Molecular Sciences
- Том: 24
- Номер: 14
- Год издания: 2023
- Издательство: MDPI
- Местоположение издательства: Basel, Switzerland
- Номер статьи: 11411
- DOI: 10.3390/ijms241411411
- Аннотация: Nematomorpha (hairworms) is a phylum of parasitic ecdysozoans, best known for infecting arthropods and guiding their hosts toward water, where the parasite can complete its life cycle. Over 350 species of nematomorphs have been described, yet molecular data for the group remain scarce. The few available mitochondrial genomes of nematomorphs are enriched with long inverted repeats, which are embedded in the coding sequences of their genes—a remarkably unusual feature exclusive to this phylum. Here, we obtain and annotate the repeats in the mitochondrial genome of another nematomorph species—Parachordodes pustulosus. Using genomic and transcriptomic libraries, we investigate the impact of inverted repeats on the read coverage of the mitochondrial genome. Pronounced drops in the read coverage coincide with regions containing long inverted repeats, denoting the ‘blind spots’ of short-fragment sequencing libraries. Phylogenetic inference with the novel data reveals multiple disagreements between the traditional system of Nematomorpha and molecular data, rendering several genera paraphyletic, including Parachordodes.
- Добавил в систему: Алёшин Владимир Вениаминович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | 2023-Parachordodes_pustulosus_mitochondrial_genome.pdf | 5,4 МБ | 1 сентября 2023 [olga_popova] |