|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Изучение возможности распараллеливания алгоритма МГУА в решении задач QSAR с применением графических ускорителей на платформе OPENCLстатья Исследовательская статья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАКСтатья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
- Авторы: Кумсков М.И., Локтев Д.К., Васильева В.О.
- Журнал: Pattern Recognition and Image Analysis: Advances in Mathematical Theory and Applications
- Том: 34
- Год издания: 2024
- Издательство: Pleiades Publishing, Ltd
- Местоположение издательства: Road Town, United Kingdom
- Аннотация: В работе рассмотрены основные проблемы решения задачи QSAR задачи (Quantitative Stricture-Activity Relationship) как задачи прогнозирования биологической активности органических соединений. В качестве одного из способов решения данной задачи рассматриваются Метод Группового Учета Аргументов(МГУА) и МГУА-подобные алгоритмы, которые позволяют использую матрицу-дескриптор для молекулы и вектор с целевым свойством, которое необходимо спрогнозировать, построить модель, которая позволит с достаточной точностью спрогнозировать целевое свойство нового соединения. Большинство МГУА и МГУА подобных алгоритмов обладают качественным недостатком – они крайне требовательны к вычислительным возможностям и обладают высокой комбинаторной сложностью, что значительно увеличивает время необходимое на построение модели. Целью данной работы является изучение возможности оптимизации процесса построения модели путем распределения задачи построения на несколько вычислительных устройств, в том числе гетерогенных. Реализовано данное распараллеливание было на языке C/C++ с применением технологии OpenCL. В результате работы, было разработано программное обеспечение и проведены вычислительные эксперименты, показывающие, что при применении графических ускорителей в решении задачи QSAR возможно значительно сократить время необходимое на вычисления.
- Добавил в систему: Кумсков Михаил Иванович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Statya._Loktev_Dmitrij_Konstantinovich.pdf | 523,7 КБ | 7 июня 2024 [kumskov] |